结论：合同中约定房屋过户无效，并不必然导致赔偿金条款也无效。赔偿金条款是否有效，需根据具体情况判断，主要看其是否违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。

分析说明：

1. 合同条款的独立性：

   • 合同中的各个条款通常是相互独立的，一个条款的无效并不必然导致其他条款也无效。除非该无效条款是合同的核心条款，且其他条款的履行依赖于该核心条款的有效性。
   • 在房屋买卖合同中，房屋过户条款和赔偿金条款往往具有相对独立性。过户条款涉及房屋所有权的转移，而赔偿金条款则是对一方违约时给对方造成损失的补偿约定。

2. 赔偿金条款的有效性判断：

   • 合法性：赔偿金条款必须合法，即不得违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。如果赔偿金条款约定的赔偿金额过高或过低，且无法证明其合理性，可能因显失公平而被法院调整或认定无效。但单纯的过户无效约定，并不直接影响赔偿金条款的合法性。
   • 关联性：赔偿金条款应与违约行为具有关联性。如果房屋过户无效是由于一方违约导致的，且赔偿金条款明确约定了因违约导致的损失赔偿方式，那么该赔偿金条款在违约发生时通常是有效的。

3. 具体案例分析：

   • 假设合同中约定：“因卖方原因导致房屋无法过户的，卖方应向买方支付合同总价款20%的赔偿金。”若后续因卖方原因确实导致房屋无法过户，且该赔偿金条款不违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗，那么买方有权要求卖方按照约定支付赔偿金。
   • 反之，如果合同中约定的赔偿金条款本身存在违法情形（如约定赔偿金额过高且无法证明合理性），或者与违约行为无关联性（如约定因买方个人原因导致无法过户时卖方也需支付赔偿金），则该赔偿金条款可能被认定无效。

行动建议：

• 审查合同条款：仔细审查房屋买卖合同中的过户条款和赔偿金条款，确保它们合法、有效且相互独立。
• 咨询专业意见：如果对合同条款的有效性存在疑问，或者遇到合同纠纷，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。
• 保留证据：在合同履行过程中，注意保留相关证据（如沟通记录、付款凭证等），以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。

法律后果提示：

• 如果赔偿金条款被认定有效，违约方需按照约定支付赔偿金，否则可能面临法律诉讼和强制执行的风险。
• 如果赔偿金条款被认定无效，违约方可能只需承担实际损失赔偿责任，而无需支付约定的赔偿金。但具体责任承担方式还需根据合同约定和法律规定综合判断。