公司恶意扣除提成，你可以通过以下途径来维护自己的合法权益：
与公司协商：
- 首先，尝试与公司进行友好协商，明确表达你对提成扣除的异议，并要求公司给出合理的解释和依据。
- 在协商过程中，保留好相关证据，如劳动合同、提成制度、工资条等，以便在后续维权过程中使用。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉公司的违法行为。
- 劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求公司改正违法行为，如补发被扣除的提成等。
- 投诉时，需要提供相关证据和详细的情况说明，以便劳动监察部门能够准确了解问题并作出处理。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门未能解决问题，或者你对劳动监察部门的处理结果不满意，你可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 劳动仲裁委员会将依法对争议进行裁决，并作出具有法律效力的仲裁裁决书。
- 在申请劳动仲裁时，同样需要提供相关证据和详细的情况说明，以支持你的仲裁请求。
提起诉讼：
- 如果劳动仲裁裁决未能满足你的诉求，或者你对仲裁裁决不服，你可以向人民法院提起诉讼。
- 法院将依法对案件进行审理，并作出判决。如果判决支持你的诉求，公司将需要履行判决义务，如支付被扣除的提成等。
在维权过程中，你需要注意以下几点：
- 保留证据：无论是与公司协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁还是提起诉讼，都需要提供相关证据来支持你的主张。因此，务必保留好与提成相关的所有证据，如劳动合同、提成制度、工资条、业绩记录等。
- 了解法律：在维权前，建议先了解相关的法律法规和政策，以便更好地维护自己的权益。你可以咨询专业律师或者查阅相关法律资料来获取这些信息。
- 及时行动：一旦发现公司存在恶意扣除提成的行为，应及时采取行动进行维权。拖延时间可能会导致证据丢失或者维权难度增加。
如果公司恶意扣除提成，可能面临的法律后果：
- 补发提成：如果公司被认定存在恶意扣除提成的行为，劳动监察部门或法院可能会要求公司补发被扣除的提成。
- 支付赔偿金：除了补发提成外，公司还可能需要支付赔偿金作为对你权益的损害赔偿。
- 行政处罚：如果公司的行为违反了相关法律法规，劳动监察部门还可能对公司进行行政处罚，如罚款、责令改正等。
如果你在维权过程中遇到任何问题或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。