核心结论：若车辆大本（即机动车登记证书）在他人手中且车辆被法院冻结，您需要分情况处理，具体如下：

1. 确认冻结原因与合法性
   首先需通过法院或执行机关（如执行法官、12368司法服务热线）查询冻结的具体原因、执行案件信息及冻结依据（如判决书、执行裁定书）。若冻结系因您自身债务（如未履行生效判决），则需直接面对执行程序；若冻结与您无关（如他人冒用身份或车辆被非法抵押），则需立即提出执行异议。

2. 分情况处理车辆大本在他人手中的问题

   • 情况一：车辆大本被他人非法持有
     若他人通过盗窃、欺诈等非法手段获取车辆大本，您应立即向公安机关报案，取得《受案回执》或《立案通知书》，并持该证据向法院提出书面执行异议（《民事诉讼法》第234条），主张冻结行为侵害您的合法权益，要求解除冻结。同时，可要求公安机关追缴车辆大本，恢复您的物权凭证。
     
   • 情况二：车辆大本被他人合法持有（如抵押、质押）
     若您曾将车辆大本作为抵押物或质押物交付他人（如贷款时抵押给银行或民间借贷），且冻结系因该债权纠纷引发，您需先与债权人协商还款或达成和解协议。若无法协商，法院可能依法拍卖车辆以清偿债务。此时，您可主张车辆实际价值高于债务金额，要求剩余款项返还（《民法典》第410条）。
     
   • 情况三：车辆被他人冒名登记或转让
     若他人伪造您的签名将车辆过户至自己名下，导致车辆大本被其持有且被冻结，您需通过行政诉讼撤销错误的车辆登记（起诉车管所），同时向法院提出执行异议之诉（《民事诉讼法解释》第304条），确认车辆所有权归属，要求停止执行。

3. 关键法律程序与证据收集

   • 执行异议：需在冻结公告期或知道冻结后15日内向法院提交书面异议，附上车辆购买合同、付款凭证、车辆大本原件（若能取回）、报案记录等证据。
     
   • 执行异议之诉：若异议被驳回，可在15日内向法院起诉，主张车辆所有权，需提供车辆登记信息、实际使用证据（如保险、维修记录）等。
     
   • 刑事报案：若涉及伪造证件、诈骗等犯罪，公安机关立案后，法院可能中止执行，待刑事案件结果确定后再恢复。

4. 风险提示与建议

   • 车辆被冻结期间，您不得擅自处置车辆（如转让、抵押），否则可能构成拒不执行判决罪（《刑法》第313条）。
     
   • 若车辆被拍卖，您有权优先受偿抵押权（如有），但需在执行分配程序中主动申报债权。
     
   • 建议委托律师协助调查车辆登记状态、冻结法律关系，并制定诉讼策略，以提高维权效率。

行动建议：立即联系执行法院查询案件信息，同时根据车辆大本持有人的身份及冻结原因，选择上述对应方案处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。