结论：对于没有取得施工许可证擅自开工的行为，处罚机关通常为有管辖权的发证机关，一般是当地的建设行政主管部门，如住房和城乡建设局。该机关将依据相关法律法规对违规行为进行处罚，包括责令停止施工、限期改正以及罚款等。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》第六十四条，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，将受到责令改正、责令停止施工及可能处以罚款的处罚。
   • 《建筑工程施工许可管理办法》第十二条进一步明确了处罚措施，对于上述违规行为，由有管辖权的发证机关责令停止施工，限期改正，并对建设单位处工程合同价款1%以上2%以下的罚款，对施工单位处3万元以下的罚款。

2. 处罚机关：

   • 处罚机关通常为有管辖权的发证机关，这一般是当地的建设行政主管部门，如住房和城乡建设局。该机关负责施工许可证的发放和管理，对违规行为进行查处。

3. 处罚措施：

   • 责令停止施工：这是一种及时的行政强制措施，旨在制止违法行为，防止工程质量、安全以及周边环境受到进一步影响。
   • 限期改正：责任单位需在规定期限内补办施工许可证等相关手续，使施工行为合法化。改正期限由发证机关根据具体情况合理确定。
   • 罚款：
     • 对建设单位的罚款数额为工程合同价款的1%至2%。例如，若某项目工程合同价款为1000万元，未办理施工许可证擅自开工，建设单位可能面临10万元至20万元的罚款。
     • 对施工单位的罚款为3万元以下，以促使施工单位在承接项目时严格审查建设单位的相关手续。

4. 特殊情况考虑：

   • 如果因发证机关及其工作人员的原因导致建设单位未能及时取得施工许可证而施工，建设单位和施工单位将不会受到上述罚款处罚。这强调了发证机关在信息公开和程序透明方面的责任。

建议与提醒：

• 为避免不必要的法律风险和经济损失，建设单位在开工前应严格按照相关规定办理施工许可证。
• 如已擅自开工，应立即停止施工，并尽快补办施工许可证，以减少可能的处罚和损失。
• 在整个过程中，建设单位和施工单位应积极配合相关部门的调查和处理工作，确保工程项目的合法合规进行。

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