结论：摩托车驾驶证和小车驾驶证合并后，若开小车时接打电话被发现扣分，这一扣分记录会同时体现在合并后的驾驶证上，且主要影响的是小车驾驶资格，但在特定情况下也可能对摩托车驾驶资格产生间接影响。
详细分析：
驾驶证合并的含义：
- 当摩托车驾驶证（如D证、E证）与小车驾驶证（C证）合并后，实际上形成了一个新的驾驶证，通常称为“C+D”或“C+E”证。这个合并后的驾驶证同时具备了驾驶小车和摩托车的资格。
扣分记录的影响：
- 扣分记录是针对驾驶证本身的，而不是针对特定的驾驶资格（如小车或摩托车）。因此，当开小车时因接打电话被扣分，这一扣分记录会直接记录在合并后的驾驶证上。
- 扣分记录主要影响的是驾驶证的持有者的驾驶行为评价，以及可能面临的处罚（如罚款、暂扣驾驶证、吊销驾驶证等）。这些处罚通常与驾驶行为本身相关，而不是与特定的驾驶资格相关。
对摩托车驾驶资格的影响：
- 在一般情况下，开小车时的扣分记录不会直接影响摩托车驾驶资格。因为扣分是针对驾驶证整体的，而不是针对某一特定类型的驾驶资格。
- 然而，如果扣分累计达到一定数量（如12分），驾驶证可能会被暂扣或吊销。在这种情况下，由于摩托车驾驶资格和小车驾驶资格已经合并，因此驾驶证的暂扣或吊销将同时影响两种驾驶资格。
法律建议：
- 无论驾驶何种车辆，都应严格遵守交通规则，避免接打电话等分心驾驶行为，以维护自身和他人的安全。
- 如果因驾驶行为不当被扣分，应及时了解扣分原因和处罚措施，并按照要求接受处理。
- 若对扣分记录或处罚措施有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
特殊情况说明：
- 在某些地区或特定情况下，交通管理部门可能会对驾驶证的扣分管理有更为严格的规定。例如，对于某些严重交通违法行为，可能会直接吊销驾驶证的所有驾驶资格（包括小车和摩托车）。因此，在实际操作中，还需根据当地的具体规定和实际情况来判断。
总结：摩托车驾驶证和小车驾驶证合并后，开小车接打电话被扣分，这一扣分记录会同时体现在合并后的驾驶证上，并主要影响小车驾驶资格。但在特定情况下（如扣分累计达到一定数量或存在严重交通违法行为），也可能对摩托车驾驶资格产生间接影响。因此，建议驾驶员严格遵守交通规则，避免分心驾驶行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。