要证明自建房的合法性，主要需要从宅基地申请、建房审批以及（如涉及经营用途）安全鉴定等几个方面来综合考量。以下是一个详细且清晰的解答：

一、宅基地申请与建房审批的合法性证明

1. 确认申请资格：

   • 必须是所在农村集体经济组织成员。您可以通过微信搜索“农业农村部政务通”小程序，点击“三资监管”一栏来确认自己的成员身份。

2. 提交申请材料：

   • 以户为单位，向村集体（或村民小组、村委会）提交宅基地使用权申请，明确建房理由、用地位置、面积、层高等内容。
   • 申请材料通常包括《农村宅基地和建房(规划许可)申请表》、户口簿及身份证复印件、《宅基地使用承诺书》等。

3. 集体审查与公示：

   • 村集体对申请材料进行审查，并提出意见。
   • 由村集体成员大会或成员代表大会集体讨论，通过后在村集体内公示。

4. 乡镇审批：

   • 公示无问题后，村集体将材料报乡镇人民政府或街道办事处审批。
   • 乡镇人民政府组织工作人员现场审查，根据情况决定是否批准，并核发《乡村建设规划许可证》和《农村宅基地批准书》。
   • 如涉及占用农用地，需依法办理农用地转用审批手续。

5. 取得合法证件后建房：

   • 农户取得上述两证后，即可按照批准的内容进行建房。

二、经营性自建房的安全鉴定合法性证明（如适用）

如果您的自建房用于经营用途，那么除了上述宅基地申请与建房审批的合法性证明外，还需要进行安全鉴定并取得合格证明：

1. 委托安全鉴定：

   • 房屋产权人（或使用人）需委托有资质的房屋安全鉴定机构对整栋房屋进行安全检测。

2. 取得安全鉴定合格报告：

   • 鉴定机构出具与经营业态相适应的房屋安全鉴定合格报告。

3. 申请合格证明：

   • 携带本人身份证、房产证（或房屋租赁合同）、鉴定报告（复印件）向房屋所在地村委会（社区）提出申请。
   • 村委会（社区）核查房屋基本情况后，提交至所属乡镇（街办）。
   • 乡镇（街办）依据鉴定报告结论和村委会（社区）核查意见，出具“该房屋经鉴定为安全房屋，可用于经营活动”的证明意见。

三、其他注意事项

• 遵守相关法律法规：在自建房过程中，应严格遵守国家及地方关于宅基地管理、城乡规划、建筑安全等方面的法律法规。
• 不得违法违规建设：如擅自改建加层、变动建筑主体和承重结构、非法开挖地下空间等行为都是违法的，将受到严厉查处。
• 及时更新自建房信息：建立安全隐患“自知、自查、自改”工作机制，动态更新自建房信息，确保房屋安全。

综上所述，要证明自建房的合法性，您需要确保宅基地申请与建房审批流程合法合规，并在涉及经营用途时取得安全鉴定合格证明。同时，遵守相关法律法规，不得违法违规建设，并及时更新自建房信息。