结论：套取公款用于公务，一般认定为贪污罪，而非单纯的违纪行为。不过，具体还需结合行为人的主观故意、行为手段及公款用途等综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、法律定性角度

1. 贪污罪的构成：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条，国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的，构成贪污罪。这里的“骗取”手段，就涵盖了通过虚假发票、虚报项目等方式套取公款的行为。
   • 关键在于行为人主观上具有非法占有公共财物的故意，并且实施了套取公款的行为。即使后续款项用于公务支出，也不能改变其最初套取公款行为的违法性。

2. 违纪与犯罪的界限：

   • 违纪行为通常指违反单位内部规章制度或行业规范的行为，其性质相对较轻，主要受到行政处分或内部纪律处分。
   • 而贪污罪是刑事犯罪，涉及对公共财物的非法占有，侵犯了国家工作人员的职务廉洁性和公共财产的所有权，需要承担刑事责任。

二、司法实践角度

1. 案例分析：

   • 案例一：某单位负责人通过虚假发票套取公款用于公务接待，虽款项用于公务，但法院仍认定其构成贪污罪，考虑用途从轻处罚。
   • 案例二：某部门工作人员虚报项目套取公款用于弥补办公经费不足，同样被认定为贪污罪，法院在量刑时考虑了款项用途。
   • 案例三：某国有企业分公司经理截留收入套取公款用于发放职工福利，也被认定为贪污罪，尽管动机非完全个人私利，但法律定性不变。

2. 司法认定原则：

   • 司法实践中，对于套取公款用于公务支出的行为，一般认定为贪污罪。关键在于行为人主观上具有非法占有公共财物的故意，并且实施了套取公款的行为。
   • 款项的具体用途，如用于公务接待、办公经费、职工福利等，虽然可能在量刑时作为从轻或减轻处罚的情节考虑，但不影响贪污罪的定性。

三、法律后果角度

1. 刑事责任：

   • 构成贪污罪的，根据贪污数额和情节轻重，可能面临有期徒刑、无期徒刑甚至死刑的刑罚，并处没收财产。

2. 行政处分与内部纪律处分：

   • 即使行为不构成贪污罪，也可能因违反单位内部规章制度或行业规范而受到行政处分或内部纪律处分，如警告、记过、降职、撤职等。

四、建议与提醒

1. 增强法律意识：

   • 国家工作人员应增强法律意识，严格遵守财经纪律和法律法规，不得利用职务之便套取公款。

2. 规范财务管理：

   • 单位应建立健全财务管理制度，加强内部审计和监督，防止公款被套取或挪用。

3. 及时咨询与处理：

   • 如果发现套取公款的行为，应及时向相关部门报告并配合调查处理。对于涉嫌贪污罪的，应依法追究刑事责任。

总结：套取公款用于公务，一般认定为贪污罪，而非单纯的违纪行为。在司法实践中，法院会综合考虑行为人的主观故意、行为手段及公款用途等因素进行定性和量刑。因此，国家工作人员应严格遵守法律法规，不得利用职务之便套取公款。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。