在摩托车与电动车发生事故，且电动车被认定为次要责任的情况下，赔偿问题主要遵循以下原则和步骤进行：

1. 责任划分与赔偿原则：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车与非机动车驾驶人之间发生交通事故，非机动车驾驶人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任。这意味着，在摩托车与电动车的事故中，如果电动车方被认定为次要责任，那么摩托车方将承担主要赔偿责任，但赔偿比例会根据电动车方的过错程度相应减轻。

2. 赔偿项目与计算方式：

   • 医疗费用：包括挂号费、检查费、治疗费、药费、住院费等实际发生的费用，凭医疗机构的收费凭证进行赔偿。
   • 误工费：如果受害人（摩托车方或电动车方，根据实际情况确定）因伤导致误工，可以根据其收入情况和误工时间计算误工费。计算公式通常为：误工费 = 误工时间 × 每日收入。
   • 护理费：受害人因伤需要护理的，可以主张护理费。护理费的标准根据护理人员的收入和护理时间确定。
   • 营养费：根据受害人的伤情和医生的建议，可以主张一定的营养费，具体金额需根据实际情况评估。
   • 残疾赔偿金：如果受害人因伤致残，可以根据伤残等级主张残疾赔偿金。计算公式通常为：残疾赔偿金 = 伤残等级系数 × 上一年度城镇居民人均可支配收入（或农村居民人均纯收入）× 赔偿年限。
   • 精神损害抚慰金：在特定情况下，如受害人因事故遭受严重精神损害，还可以主张精神损害抚慰金，具体金额需根据实际情况和法院判决确定。

3. 保险赔偿流程：

   • 交强险赔偿：摩托车作为机动车辆，必须投保交强险。在事故发生后，摩托车方的交强险将首先在责任限额内进行赔偿。交强险的赔偿限额分为死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。对于医疗费用，赔偿限额通常为18000元。
   • 商业险赔偿：如果摩托车方还购买了商业保险，如第三者责任险等，那么在交强险赔偿不足的情况下，商业险将提供额外的保障。商业险的赔偿范围和限额将根据具体保险合同确定。

4. 实际操作建议：

   • 保留证据：在整个事故处理和赔偿过程中，务必保留好所有相关证据，如事故现场照片、医疗记录、费用凭证等。这些证据将对于后续的保险理赔和可能的法律诉讼至关重要。
   • 及时沟通：与保险公司保持密切沟通，及时了解理赔进度和所需材料。同时，也可以与电动车方进行协商，尝试达成和解协议，以加快赔偿进程。
   • 法律途径：如果与保险公司或电动车方就赔偿问题无法达成一致，可以通过法律途径解决争议。此时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保障。

示例说明： 假设摩托车方因事故产生了医疗费用20000元、误工费5000元、护理费2000元等损失，且电动车方被认定为次要责任（假设承担30%的责任）。那么，在交强险医疗费用赔偿限额内（18000元），摩托车方将首先获得18000元的赔偿。剩余的医疗费用2000元以及其他损失（如误工费、护理费等）将根据责任比例进行分担。即电动车方需承担剩余医疗费用的30%（600元）以及其他损失的30%（具体金额需根据各项损失的实际金额计算）。如果摩托车方还购买了商业保险，那么剩余的损失部分可能还可以通过商业保险进行进一步赔偿。

总之，在摩托车与电动车发生事故且电动车被认定为次要责任的情况下，赔偿问题需要根据责任划分、赔偿项目与计算方式以及保险赔偿流程等多个方面进行综合考虑和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。