核心结论：农户贷逾期自动扣款问题，需分情况处理，具体如下：

1. 确认扣款合法性
   首先需核实扣款是否基于合法有效的贷款合同条款。若合同中明确约定了逾期自动扣款条款（如授权银行从指定账户划扣资金），且该条款未违反《民法典》第496条（格式条款无效情形）或《商业银行信用卡业务监督管理办法》等强制性规定，则扣款行为具有合法性。此时，您需重点检查：

   • 合同是否由本人签署且未被篡改；
     
   • 扣款账户是否为合同约定的账户；
     
   • 扣款金额是否与逾期本金、利息、违约金等总和一致。
     若扣款合法，您需承担逾期责任，但可与银行协商减免部分违约金或延长还款期限。

2. 处理非法扣款情形
   若扣款存在以下问题，可主张权利：

   • 未授权扣款：合同无自动扣款条款，或您未签署相关授权书（如《代扣协议》），银行擅自扣款的，构成侵权。您可依据《民法典》第1165条要求银行返还资金，并赔偿损失（如因扣款导致的其他账户透支利息）。
     
   • 超额扣款：扣款金额超过合同约定的逾期费用（如仅应扣本金+利息，但银行额外扣取“催收费”“管理费”等无合同依据的费用），您可要求银行退还超额部分，并可向当地银保监会投诉（电话：12378）。
     
   • 扣错账户：银行误扣他人账户资金的，您需立即联系银行更正，并协助被扣款人追偿；若因银行过错导致您承担连带责任（如被扣款人起诉您），可向银行追偿。

3. 应对逾期的后续措施

   • 协商还款：主动联系银行说明逾期原因（如自然灾害导致收入减少），提供证明材料（如村委会出具的受灾证明），申请延期还款、分期还款或减免部分利息。根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第70条，银行应与持卡人平等协商，不得强制要求一次性还款。
     
   • 异议处理：若对逾期记录有异议（如已还款但银行未及时更新系统），可向银行提出书面异议申请，要求更正征信记录；若银行拒绝，可向当地人民银行征信中心申请异议核查（网址：pbccrc.org.cn）。
     
   • 法律救济：若银行存在暴力催收（如频繁骚扰亲友、威胁恐吓）、虚假宣传等违法行为，可保留证据（如录音、短信）并向公安机关报案，或通过“中国互联网金融协会”官网举报平台投诉。

行动建议：

1. 立即核对银行扣款记录与合同条款，确认扣款是否合法；
   
2. 若扣款非法，收集证据（合同、扣款凭证、沟通记录）并书面要求银行退还；
   
3. 若协商无果，可向当地银保监会或人民银行分支机构投诉，或直接向法院起诉（小额诉讼程序费用低、效率高）。
   

提示：农户贷通常涉及政策性优惠（如低息、贴息），若银行违规操作可能影响政策落实，您可同步向当地农业农村局反映情况。