用您的公司与煤矿法人签订的合作协议，在符合法定条件的情况下是有效的。以下从多个角度为您详细分析：
一、协议有效的基本条件
主体适格：
- 您的公司作为签订协议的一方，必须具备合法的民事主体资格，即依法成立并有效存续。
- 煤矿法人作为另一方，也必须是依法成立并有效存续的法人实体，具有签订合同的民事权利能力和行为能力。
意思表示真实：
- 双方签订协议时，必须基于真实、自愿的意思表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。
内容合法：
- 协议内容必须符合法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗。例如，协议中不得包含非法交易、走私、贩毒等违法内容。
形式合法：
- 根据法律规定或双方约定，协议可能需要采用书面形式或其他特定形式。对于合作协议，通常建议采用书面形式，以便明确双方的权利义务，减少纠纷。
二、可能影响协议效力的特殊情况
煤矿法人的授权问题：
- 如果煤矿法人是由其法定代表人或授权代表签订协议，需要确保该代表具有合法的授权。否则，协议可能因无权代理而无效或效力待定。
协议内容的具体性：
- 协议应明确双方的合作内容、方式、期限、权利义务、违约责任等关键条款。如果协议内容过于模糊或存在重大遗漏，可能导致协议无法履行或产生纠纷。
法律法规的特别规定：
- 某些行业或领域可能受到特别法律法规的监管，如矿业权转让、安全生产等。在签订合作协议时，需要确保协议内容符合这些特别规定，否则可能面临法律风险。
三、法律建议
审查对方资质：
- 在签订协议前，建议对煤矿法人的资质、信誉、经营状况等进行全面审查，确保对方具备履行协议的能力。
明确协议条款：
- 协议应尽可能详细、明确地约定双方的权利义务、违约责任等关键条款，以减少纠纷的发生。
咨询专业律师：
- 在签订重要合作协议前，建议咨询专业律师的意见，确保协议内容合法、有效，并符合双方的利益需求。虽然这里我作为桑文君律师已经给出了一些基本建议，但具体协议的起草和审查仍需要更详细、专业的法律服务。
保留相关证据：
- 在协议履行过程中，建议保留好与协议相关的所有证据，如付款凭证、交货单、沟通记录等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
如果您在签订或履行合作协议过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细、专业的法律建议。