企业合作在以下情况下会被认定为关联交易：
股权控制关系
- 当一方直接或间接持有另一方的股份总和达到25%或以上时，这种持股关系，无论是直接的还是通过第三方间接实现的，都构成关联关系。例如，A公司持有B公司30%的股份，那么A公司和B公司之间就存在关联关系。
- 若两个企业同为第三者所控制，且该第三者对这两个企业的持股比例均达到25%或以上，这两个企业也被视为关联企业。比如，C公司同时持有D公司和E公司各30%的股份，那么D公司和E公司之间就因C公司的控制而构成关联关系。
资金借贷关系
- 如果一方与另一方（非独立金融机构）之间的借贷资金占一方实收资本的50%以上，或者一方借贷资金总额的10%以上是由另一方担保，那么这种资金借贷关系就构成了关联关系。例如，F公司向G公司借款，且借款金额占F公司实收资本的60%，那么F公司和G公司之间就存在关联关系。
人员控制关系
- 当一方半数以上的高级管理人员（包括董事会成员和经理）或由另一方委派至少一名可以控制董事会的董事会高级成员时，视为存在关联关系。比如，H公司委派了其高管到I公司担任董事会成员，且该高管在I公司董事会中具有决定性影响力，那么H公司和I公司之间就存在关联关系。
- 若一方的高级管理人员同时担任另一方的高级管理人员，也可能被认定为关联企业。例如，J公司的总经理同时兼任K公司的副总经理，且对K公司的经营决策有重大影响，那么J公司和K公司之间就存在关联关系。
经营控制关系
- 如果一方的生产经营活动必须依赖另一方提供的工业产权、专有技术等特许权才能正常进行，那么这种依赖关系就构成了关联关系。比如，L公司必须使用M公司提供的专利技术才能生产其产品，那么L公司和M公司之间就存在关联关系。
- 当一方的购买或销售活动主要由另一方控制，或者一方的原材料采购、产品销售等经营活动受另一方决定性影响时，也表明存在关联关系。例如，N公司的原材料全部由O公司提供，且O公司对N公司的采购价格有决定性影响，那么N公司和O公司之间就存在关联关系。
其他关联关系
- 企业之间存在特殊的合作协议，或企业的高级管理人员存在亲属关系，且这种关系对企业的经营决策产生影响时，可能被视为关联企业。比如，P公司和Q公司之间签订了长期合作协议，且P公司的高管与Q公司的实际控制人是亲属关系，这种关系对两公司的合作决策有重大影响，那么P公司和Q公司之间就存在关联关系。
- 即使不符合上述具体标准，但如果一方对另一方具有实际控制权，能够决定其财务和经营政策，并从中获取利益，也构成关联关系。这种实际控制权可能通过多种方式实现，如协议控制、家族控制等。
法律依据：
- 《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第一百零九条明确了关联方的定义，包括在资金、经营、购销等方面存在直接或间接控制关系，以及直接或间接地同为第三者控制或在利益上具有相关联的其他关系的企业、其他组织或个人。
- 《特别纳税调整实施办法（试行）》也进一步细化了关联关系的认定标准，涵盖了股权控制、借贷资金控制、管理人员任职和兼任、生产经营和购销活动控制等多个方面。
综合判断与建议：
在实际操作中，认定企业之间的关联关系需要综合考虑上述多个因素，并根据具体情况进行综合分析。不同行业、不同地区以及不同的监管要求可能会对关联关系的认定产生一定影响。因此，企业在合作过程中应仔细研究相关规定，并结合实际情况进行判断，以避免因关联交易而引发的法律风险和税务问题。如果企业对于关联交易的认定存在疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询，我会根据企业的具体情况提供专业的法律意见。