在追尾事故中，如果您被认定为全责方，那么赔偿对方修车期间的通行费（通常指交通费）是合理且合法的。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》：该法典明确规定，因他人过错导致自身财产受损而产生的间接损失，包括交通费损失，应当予以赔偿。这意味着，如果由于您的追尾行为导致对方车辆受损并需要修理，那么对方因此产生的合理交通费用，您有义务进行赔偿。
《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条：该条款进一步明确，因道路交通事故造成非经营性车辆无法继续使用，所产生的通常替代性交通工具的合理费用，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持。这为您需要赔偿对方修车期间的交通费提供了直接的法律依据。
二、合理性分析
事故责任：在追尾事故中，如果您被认定为全责方，那么您对此次事故造成的所有损害都负有赔偿责任。这包括对方车辆因修理而无法使用期间产生的交通费用。
日常出行影响：对方车辆因事故受损需要修理，期间无法正常使用。这会对对方的日常出行造成不便，如上班、上学、购物等。为了维持正常的生活和工作节奏，对方可能需要选择其他交通工具作为替代，如公共交通、打车或租车等。这些都会产生额外的费用，而这些费用是由于您的过错导致的。
费用关联：对方产生的交通费用与您的追尾行为有直接的因果关系。如果没有您的追尾行为，对方车辆就不会受损，也就不需要修理，更不会产生交通费用。因此，您有义务对这部分费用进行赔偿。
三、赔偿标准及注意事项
赔偿标准：交通费的赔偿应以实际发生且合理为限。具体金额应根据对方提供的有效票据来确定，如打车发票、租车合同及费用凭证、公交卡充值记录等。这些票据应能够证明对方确实产生了这些费用，并且这些费用是合理的。
合理性判断：如果对方提出的交通费过高或者不合理，您有权提出异议。例如，如果对方日常主要依赖公共交通工具出行，那么赔偿金额应参照其乘坐公共交通的费用；如果对方主要依靠私家车出行，那么可按其使用车辆的合理成本进行计算。在判断合理性时，应考虑对方的实际出行需求和当地的交通状况。
协商与诉讼：双方应首先尝试通过友好协商的方式解决赔偿问题。这可以节省时间和成本，并且有助于维护双方的关系。如果协商无果，受损方有权向法院提起诉讼，由法院根据具体情况进行综合判定。在诉讼过程中，双方应提供充分的证据来支持自己的主张。
综上所述，追尾事故中全责方赔偿对方修车期间的交通费是合理且合法的。在实际操作中，双方应依据法律规定和实际情况进行协商和处理，以确保赔偿的公正性和合理性。如果您对此有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。