未经过进京检查站可能面临的处罚需根据具体情节判断，主要涉及违反《中华人民共和国治安管理处罚法》或《中华人民共和国道路交通安全法》，情节严重可能涉及刑事责任。以下是具体分析：

1. 若行为属于逃避检查或拒不配合检查
   根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十条，若行为人故意绕行检查站、冲卡或以其他方式逃避检查，可能被认定为“阻碍国家机关工作人员依法执行职务”，处警告或200元以下罚款；情节严重的（如多次逃避、暴力抗法等），处5-10日拘留，可并处500元以下罚款。
   例如：驾驶车辆强行冲卡、翻越护栏绕行检查站等行为，可能直接适用此条款。

2. 若行为涉及无证驾驶、伪造证件等交通违法行为
   若未经过检查站的原因是未携带驾驶证、行驶证，或使用伪造、变造证件，则需根据《中华人民共和国道路交通安全法》处罚：

   • 未携带证件：扣留机动车，警告或20-200元罚款；
     
   • 伪造证件：收缴证件，扣留机动车，处15日以下拘留，并处2000-5000元罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
     例如：为逃避检查使用假车牌，可能同时触犯治安管理和交通安全法规。

3. 若行为涉及其他违法犯罪（如运输违禁品、逃避防疫检查等）

   • 运输危险物质：根据《刑法》第一百二十五条，可能处3-10年有期徒刑；
     
   • 逃避防疫检查：若违反地方政府防疫规定（如未报备、隐瞒行程），可能依据《治安管理处罚法》第五十条处罚，情节严重构成“妨害传染病防治罪”的，依《刑法》第三百三十条追究刑事责任。
     例如：明知自己为密接人员仍绕行检查站进京，可能面临刑事处罚。

建议：若已发生未经过检查站的行为，需根据具体情节评估法律风险。若被查处，应配合调查并如实说明情况；若未被查处，建议主动向相关部门说明情况（如防疫部门、交通管理部门），避免后续责任扩大。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律应对方案。