逾期违约金的纳税义务发生时间，需根据违约金的性质及具体业务场景，结合税法规定综合判断，主要分为以下两种情形：

1. 增值税场景下的纳税义务发生时间

根据《增值税暂行条例》及实施细则，增值税纳税义务发生时间为“纳税人发生应税行为并收讫销售款项或者取得索取销售款项凭据的当天”。具体到逾期违约金：

• 若违约金与销售货物、提供劳务等主合同直接相关（如因延迟交货、未履行合同义务而支付的违约金），属于“价外费用”，应随主合同一并缴纳增值税。此时纳税义务发生时间与主合同一致：
  • 采取直接收款方式的，为收到销售款或取得索款凭据的当天；
  • 采取赊销或分期收款方式的，为书面合同约定的收款日期的当天；
  • 未签订书面合同或未约定收款日期的，为货物发出或服务完成的当天。
• 若违约金独立于主合同（如因合同解除、未达成合作而支付的违约金），且未伴随任何应税行为，则不属于增值税征税范围，无需缴纳增值税。

2. 企业所得税场景下的纳税义务发生时间

根据《企业所得税法》及实施条例，企业所得税的纳税义务发生时间为“实际发生且经济利益流入企业”的当天。具体到逾期违约金：

• 若违约金属于企业实际收到的经济利益（如对方因违约支付的赔偿款），无论是否开具发票，均应在实际收到时确认收入，计入当期应纳税所得额。
• 若违约金属于企业实际支付的经济利益（如因自身违约向对方支付的赔偿款），可在实际支付时作为营业外支出税前扣除，但需满足以下条件：
  • 与生产经营活动相关；
  • 取得合法有效的凭证（如法院判决、调解书、双方签订的赔偿协议等）；
  • 不属于《企业所得税法》第十条规定的不得扣除项目（如罚款、罚金、滞纳金等）。

关键提醒

• 合同条款的重要性：建议在合同中明确约定违约金的性质、支付条件及税务处理方式，避免后续争议。
• 税务合规建议：企业收到或支付违约金时，应及时留存相关凭证（如合同、付款记录、法院文书等），并按照税法规定进行账务处理和纳税申报。

如有具体业务场景或合同条款需要分析，欢迎进一步向我咨询！