针对您提出的“农村拆迁户口是一个人但多个继承人，且有协议的情况下如何分配”的问题，这确实是一个涉及法律与家庭协议的综合问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确农村房屋拆迁补偿的构成。一般来说，农村房屋拆迁补偿主要包括两部分：一是地上房屋的补偿，二是宅基地使用权的补偿。

1. 地上房屋的补偿：

   • 这部分补偿应当归属房屋的权利人。如果房屋权利人已经去世，那么这部分拆迁补偿款就可以作为遗产，由继承人依照《中华人民共和国民法典》的规定进行继承。
   • 在您的情况下，如果拆迁的房屋是已故户主的财产，那么这部分补偿款应作为遗产，由所有继承人（根据您说的有多个继承人）按照协议或法定继承顺序进行分配。

2. 宅基地使用权的补偿：

   • 宅基地的所有权归农村集体经济组织，农民只拥有使用权。宅基地使用权具有很强的人身属性，是按户计算的。
   • 当一户出现人口减少时，宅基地仍是由一户中剩余的成员共同使用。因此，宅基地使用权的补偿款应由该户剩余的成员共同所有，这部分补偿款是不存在继承问题的。
   • 在您的情况下，如果户口上只有已故户主一人，但宅基地实际上是由家庭其他成员（如配偶、子女等）共同使用或有权使用的，那么这部分补偿款应由这些成员共同分配，而不是作为遗产由所有继承人分配。

3. 关于继承人之间的协议：

   • 如果继承人之间已经达成了分配协议，并且这个协议是合法、有效且不违反公序良俗的，那么应该按照协议来分配拆迁补偿款。
   • 协议可以明确每个继承人的分配比例或具体金额，从而避免后续的纠纷。

4. 实际操作建议：

   • 首先，确认拆迁补偿款的具体构成和金额，明确哪些部分属于地上房屋的补偿，哪些部分属于宅基地使用权的补偿。
   • 然后，根据继承人之间的协议或法定继承顺序，对地上房屋的补偿款进行分配。
   • 对于宅基地使用权的补偿款，如果户口上只有已故户主一人，但有其他家庭成员有权使用宅基地，应与这些成员协商分配。
   • 如果协商不成或存在争议，可以寻求法律途径解决，如向法院提起诉讼。

综上所述，农村拆迁户口是一个人但多个继承人的情况下，拆迁补偿款的分配需要综合考虑房屋权利、宅基地使用权以及继承人之间的协议或法定继承顺序。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。