拆迁协议一般不可以直接按继承份额分开签，但可以通过后续处理实现按继承份额分配利益的目的。以下从不同角度为你详细分析：

从拆迁协议签订主体和性质角度

拆迁协议是拆迁人与被拆迁人就房屋拆迁补偿安置等事项达成的协议，其签订主体通常是房屋的所有权人或者经所有权人授权的代表。在拆迁过程中，拆迁部门一般是与被拆迁房屋的整体权利人进行协商和签订协议，而不是直接按照未来可能的继承份额来分别与各个潜在继承人签订协议。

例如，一个家庭拥有一套被拆迁的房屋，房屋登记在父母名下。在拆迁时，拆迁部门通常是与父母作为被拆迁人签订一份拆迁协议，而不是按照子女未来可能继承的份额分别与每个子女签订协议。这是因为拆迁协议签订时，继承尚未发生，房屋的权利主体是明确的被拆迁人，拆迁部门是基于房屋的整体权属情况进行补偿安置协商。

从继承发生后的处理角度

虽然拆迁协议不能直接按继承份额分开签，但在继承发生后，继承人可以通过一定的方式实现按继承份额分配拆迁利益。

• 协商分割：如果各继承人之间能够就拆迁补偿利益的分配达成一致意见，可以签订书面协议，明确各自按照继承份额应得的补偿部分，比如房屋补偿款、安置房面积等。例如，父母去世后留下被拆迁房屋，三个子女作为继承人协商一致，按照均等的份额分配拆迁补偿款和安置房，并签订协议约定各自的权利和义务。
• 诉讼分割：如果继承人之间无法就拆迁利益的分配达成一致，任何一方都可以向法院提起诉讼，由法院根据继承法的相关规定和具体情况，判决各继承人应得的份额。法院在审理时会综合考虑房屋的来源、各继承人对房屋的贡献、赡养情况等因素，公平合理地确定继承份额。

特殊情况

如果被拆迁房屋存在多个共有人，且共有人之间已经就房屋的份额有明确约定，在拆迁时，共有人可以按照各自的份额与拆迁部门协商拆迁补偿事宜，但这与继承份额是不同的概念。这种情况下，是基于共有人对房屋现有的权属份额进行协商，而不是基于未来可能发生的继承关系。

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