合同签订不合规的整改需要结合具体不合规情形来处理，以下是常见的整改方向及措施：

1. 审查并修正合同条款

   • 核心问题：合同条款存在违法违规内容（如违反强制性法律规定、显失公平条款、排除对方主要权利条款等），或条款约定模糊、存在歧义。
   • 整改措施：
     • 删除违法条款：直接删除违反法律、行政法规强制性规定的条款（如免除自身法定责任、加重对方责任、排除对方主要权利的条款）。
     • 补充关键条款：若合同缺少必备条款（如标的、数量、质量、价款、履行期限、违约责任等），需根据《民法典》第四百七十条补充完善。
     • 明确模糊表述：对存在歧义的条款（如“合理期限”“重大影响”等模糊表述）进行量化或具体化，例如约定“合理期限为15日”或“重大影响指导致合同目的无法实现”。

2. 完善合同形式要件

   • 核心问题：合同未采用书面形式（法律、行政法规规定需书面形式的合同）、未签字盖章、签字人无授权等。
   • 整改措施：
     • 补签书面合同：若原合同为口头形式但法律要求书面形式（如租赁合同期限超6个月），需立即补签书面合同并注明补签日期。
     • 补全签字盖章：确保合同双方或授权代表签字，并加盖公章或合同专用章（个人合同需签字并按手印）。
     • 追认授权文件：若签字人无授权，需补充授权委托书或事后追认文件，明确其代表权限。

3. 履行法定程序

   • 核心问题：需审批、登记、备案的合同未履行相关程序（如中外合资经营企业合同、抵押合同等）。
   • 整改措施：
     • 补办审批手续：向主管部门提交申请材料（如商务部门、市场监管部门），说明未及时审批的原因并承诺整改。
     • 完成登记备案：对需登记的合同（如不动产抵押合同）及时办理登记，确保合同效力。

4. 修正履行瑕疵

   • 核心问题：合同履行过程中存在违规行为（如未按约定方式交付货物、未开具发票等）。
   • ** 整改措施：
     • 补正履行行为：立即按合同约定履行义务（如补交货物、补开发票），并保留履行证据（如物流单、发票复印件）。
     • 协商补充协议：若原履行方式已无法实现，可与对方签订补充协议，变更履行方式或期限。

5. 风险防范与证据固定

   • 核心问题：整改后仍存在潜在纠纷风险（如对方不认可整改内容）。
   • 整改措施：
     • 书面确认整改：要求对方签署《合同整改确认书》，明确整改内容及双方认可。
     • 留存沟通记录：保存整改过程中的邮件、微信、录音等证据，证明已尽到合理整改义务。

提示：合同整改需结合具体行业规定（如建设工程合同需符合《建筑法》）和地方性法规，若涉及重大合同或复杂情形，建议提供合同文本及背景信息，以便进一步分析。