结论：做不满三个月辞工被扣钱是否合法，需根据具体情况判断。一般情况下，若用人单位无故克扣劳动者工资，则是不合法的；但在某些特定情况下，如劳动合同中有合法约定或劳动者违反规定，扣钱行为可能合法。
一、不合法的情况
无约定或约定不明扣钱：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》，劳动者享有取得劳动报酬的权利，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。如果用人单位与劳动者未在劳动合同中明确约定未干满三个月离职需扣工资的事项，或者以未干满规定时长等理由随意扣钱，这种行为是不合法的。
- 举例：小李在某公司工作两个月后提出辞职，公司以未干满三个月为由扣除了他一部分工资。由于双方劳动合同中并未约定此条款，因此公司的做法是不合法的。
约定违法扣钱：
- 即使劳动合同中有相关约定，但如果该约定违反了法律法规的强制性规定，如扣除的工资数额过高导致劳动者生活困难，或违反了劳动法关于最低工资标准的规定，那么扣工资也是不合法的。
- 举例：小张与公司签订的劳动合同中约定，若未干满三个月离职，需扣除当月工资的50%。由于该约定违反了法律法规的强制性规定，因此是不合法的。
未履行法定程序扣钱：
- 劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，或在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。只要劳动者按照法定程序履行了辞职手续，用人单位就应当足额支付劳动者应得的工资。
- 举例：小王在试用期内提前三日通知了公司要辞职，但公司仍以未干满三个月为由扣除了他的工资。由于小王已经履行了法定程序，因此公司的做法是不合法的。
二、合法的情况
有合法约定扣钱：
- 如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定了未干满一定期限离职需扣工资的条款，且该约定不违反法律法规的强制性规定（如培训费用扣除等），并且已经过劳动者同意，那么在这种情况下扣工资可能是合法的。但这种情况较为特殊，且需要严格符合法律法规的规定。
- 举例：小赵与公司签订的劳动合同中约定，若因个人原因未干满三个月离职，需承担公司为其支付的培训费用的一部分。由于该约定符合法律法规的规定，且已经过小赵同意，因此是合法的。
劳动者违反规定扣钱：
- 如果劳动者离职时违反了法律法规规定或公司合法有效的规章制度（如未提前通知给公司造成损失、违反保密义务、竞业限制等），且公司的规章制度已经过民主程序制定并向员工公示，那么公司依据规定扣钱是合法的。
- 举例：小孙在离职时未提前通知公司，导致公司遭受了一定的经济损失。由于公司规章制度中明确规定了此类情况下的扣钱条款，且该条款已经过民主程序制定并向员工公示，因此公司依据规定扣钱是合法的。
三、劳动者维权途径
若劳动者认为用人单位扣工资的行为不合法，可以采取以下措施维护自己的合法权益：
- 与用人单位协商解决：首先尝试与用人单位进行协商，要求返还被克扣的工资。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商不成，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：若投诉无果，劳动者还可以选择向劳动仲裁机构提起劳动仲裁，要求用人单位支付被克扣的工资及可能产生的经济补偿等费用。
总结与建议：做不满三个月辞工被扣钱是否合法，需根据具体情况判断。劳动者在离职时应仔细审查劳动合同中的相关条款，了解自己的权利和义务。若认为用人单位扣工资的行为不合法，应坚决维护自身权益，通过合法途径寻求解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。