结论：一楼业主因楼上不注意导致长期堵塞而改独立下水道，其合法性需根据具体情况综合判断，关键在于改造行为是否符合相关法律法规、是否获得必要审批、是否遵循建筑规范以及是否对其他业主造成影响。
合法情形
符合相关规定和程序：
- 一楼业主在改造下水道前，应向相关部门（如物业公司、市政部门等）提出申请，详细说明改造的原因、方式、施工时间等内容。在获得物业公司的审核批准，并确保改造不会对建筑结构安全和其他业主的正常生活造成影响后，方可进行改造。如需向市政等相关部门报备，也需按照要求完成报备手续。
- 举例：若一楼业主因下水道设计缺陷导致长期堵塞，向物业提出改造申请，并提供了详细的改造方案和施工计划，物业审核后认为改造合理且不会影响其他业主，于是批准了改造申请。在此情况下，一楼业主的改造行为是合法的。
解决合理需求且不影响他人：
- 当原有下水道设计存在缺陷或经常出现堵塞等问题，严重影响一楼业主的正常生活时，一楼业主有权采取合理、规范的改造措施来解决问题。在与其他业主和物业沟通协商，并采取不影响其他楼层排水的改造方案后，进行的下水道改造应被认为是合法的解决问题方式。
- 举例：一楼业主因下水道堵塞频繁，导致家中污水反流，严重影响了正常生活。在与楼上业主和物业沟通后，一楼业主决定在自家专有区域内改造独立下水道，并确保改造后的下水道不会影响楼上业主的排水。在此情况下，改造行为是合法的。
不合法情形
未经相关方同意：
- 下水道属于建筑物的公共设施部分，对其进行改造需征得物业、其他业主等相关方的同意。未经许可擅自更改下水道，可能侵犯其他业主的合法权益，构成违法行为。
- 举例：一楼业主未经物业和其他业主同意，擅自改造下水道，导致楼上业主家中排水不畅，引发纠纷。在此情况下，一楼业主的改造行为是不合法的。
违反建筑规范：
- 改造行为必须遵守建筑设计、施工的相关规范，不得影响建筑物的结构安全或公共安全。如在改造过程中破坏建筑物的承重墙或基础结构，将严重威胁整栋楼的安全，属于违法行为。
- 举例：一楼业主在改造下水道时，为了方便施工，擅自拆除了部分承重墙，导致建筑物结构安全受到威胁。在此情况下，改造行为是不合法的，且可能面临严重的法律后果。
破坏公共设施：
- 在改造下水道时，如损坏小区内的消防管道、通信线路等公共设施，也属于不合法行为。此种情况下，一楼业主需承担相应的赔偿责任。
- 举例：一楼业主在改造下水道时，不慎损坏了小区内的消防管道，导致消防设施无法正常使用。在此情况下，一楼业主需承担修复消防管道的费用，并可能面临行政处罚。
建议与指导
- 事先咨询与申请：一楼业主在改动下水道前，应充分咨询相关部门和专业人士的意见，确保自己的行为符合法律法规和规定标准。同时，向物业提出改造申请，并按照要求完成审批和报备手续。
- 沟通与协商：与邻居及管理部门进行沟通，说明改造的原因、方案及可能的影响，争取获得理解和支持。在改造过程中，尽可能避免对其他业主造成不良影响。
- 专业施工与监督：选择专业的施工单位进行改造，并确保施工过程符合规范，避免对建筑物造成损害。同时，接受物业和相关部门的监督，确保改造行为的合法性和安全性。
- 及时咨询：如有任何疑问或纠纷，建议直接向我咨询，以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，一楼业主因楼上不注意导致长期堵塞而改独立下水道，其合法性需根据具体情况综合判断。在改造前，务必确保符合相关法律法规、获得必要审批、遵循建筑规范且不影响其他业主权益。