结论：父亲有运输毒品罪案件，子女能否当兵需结合具体情况及当地征兵部门的政审标准来判断。一般来说，若父亲因运输毒品罪被刑事处罚，这可能会对子女的征兵政审产生不利影响，但并非绝对阻碍，具体还需看当地征兵政策及子女的个人表现。

详细分析：

1. 法律与政策背景：

   • 根据《征兵政治审查工作规定》，征集服现役的公民必须拥护中国共产党的领导，热爱社会主义国家，热爱人民军队，并具备遵纪守法、品德优良等条件。在政治审查过程中，不仅考察应征者本人，还会对其家庭主要成员、直接抚养人等的政治情况进行考量。
   • 运输毒品罪属于严重的刑事犯罪，若父亲因此被刑事处罚，这通常会被视为家庭主要成员有严重违法犯罪行为，可能影响子女的征兵政审。

2. 不同情况下的影响：

   • 父亲正在服刑期间：若父亲因运输毒品罪正在服刑，这通常会对子女的征兵政审产生较为明显的不利影响。因为军队对士兵的政治素质要求极高，家庭成员的严重犯罪行为可能被视为影响士兵忠诚度和可靠性的因素。
   • 父亲已服刑完毕：若父亲已服刑完毕，且子女在各方面都表现出色，能够证明自己与父亲的错误行为划清了界限，并且具备强烈的爱国情怀和坚定的政治立场，那么子女仍有可能通过政审并参军。但这仍需结合当地征兵部门的实际政策来判断。

3. 实际操作中的差异性：

   • 不同地区、不同岗位的征兵要求在具体执行上可能存在差异。有些地区或岗位可能对家庭成员的犯罪记录更为敏感，而有些则可能相对宽松。
   • 军队的具体招聘政策和政审标准也会影响最终判断。因此，子女在报名参军前，应详细了解相关政策和规定，特别是政审环节的具体要求。

4. 建议与应对措施：

   • 如实说明家庭情况：子女在报名参军时，应如实向征兵部门说明家庭情况，包括父亲的犯罪记录等。隐瞒或虚假陈述可能导致政审不通过或后续问题。
   • 提供相关证明材料：子女可以提供相关证明材料，如父亲的刑事判决书、服刑证明等，以证明自己与父亲的错误行为划清了界限。
   • 咨询当地征兵部门：由于法律和政策可能动态变化，且不同地区、不同岗位的征兵要求存在差异，建议子女在实际操作前咨询当地征兵部门或相关部门的工作人员，以获取最准确的信息和判断。

总结与启示： 父亲有运输毒品罪案件，子女能否当兵并非绝对，而是需根据相关法律法规、政策及具体执行情况来综合判断。子女在参军前应充分了解相关政策，做好充分准备，并根据实际情况采取相应措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。