结论前置：

1. 工资发放方式：工资超过5000元通过微信发放，本身并不违法，但需确保工资发放的合法性和合规性，包括签订书面劳动合同、明确工资构成、保留工资发放记录等。
2. 纳税义务：工资超过5000元时，需依法缴纳个人所得税，税额的计算基于应纳税所得额，并适用超额累进税率。

详细解释：

工资发放方式

在中国，工资的发放方式并不受法律严格限制，可以通过银行转账、现金、微信等多种方式支付。然而，无论采用何种方式发放工资，都需确保以下几点：

• 签订书面劳动合同：用人单位与劳动者应签订书面劳动合同，明确工资标准、支付方式、支付时间等条款，以保障双方的合法权益。
• 明确工资构成：工资应包含基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入，且应明确各项收入的金额和支付方式。
• 保留工资发放记录：用人单位应保留工资发放记录，包括工资条、银行转账记录、微信转账记录等，以备查验。

若工资通过微信发放，需特别注意：

• 确保微信转账记录的完整性和真实性：微信转账记录应清晰显示转账金额、转账时间、转账双方等信息，且不得被篡改或删除。
• 避免使用个人微信账户进行工资发放：为确保工资发放的合规性，建议用人单位使用对公账户或专用微信账户进行工资发放，避免与个人财务混淆。

纳税义务

根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，工资薪金所得属于个人所得税的征税范围。当工资超过5000元时，需依法缴纳个人所得税。税额的计算基于应纳税所得额，并适用超额累进税率。

应纳税所得额的计算：

应纳税所得额 = 税前工资 - 起征点（5000元） - 专项扣除 - 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除

• 起征点：每月基本减除费用标准为5000元。
• 专项扣除：包括居民个人按国家规定缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险、住房公积金等社会保险费。
• 专项附加扣除：涵盖子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人、3岁以下婴幼儿照护等七项。
• 依法确定的其他扣除：如个人缴付的企业年金、职业年金，以及购买符合国家规定的商业健康保险、税收递延型商业养老保险的支出等。

税率及速算扣除数：

个人所得税采用超额累进税率，根据应纳税所得额的不同，分为七个级次。具体税率和速算扣除数可参照相关税率表。

应纳税额的计算：

应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数

实际案例分析：

假设某员工某月工资为10000元，三险一金扣除1000元，有一个子女正在接受全日制学历教育，可享受每月1000元的专项附加扣除，没有其他扣除项目。

1. 计算应纳税所得额： 应纳税所得额 = 10000 - 5000 - 1000 - 1000 = 3000元

2. 查找适用税率和速算扣除数： 根据税率表，3000元对应的税率为3%，速算扣除数为0。

3. 计算应纳税额： 应纳税额 = 3000 × 3% - 0 = 90元

纳税申报与缴纳：

工资薪金所得一般由扣缴义务人（即所在单位）按月或按次预扣预缴税款。年度终了后，居民个人需在次年3月1日至6月30日内办理综合所得年度汇算清缴，确保税款多退少补。

注意事项：

• 个人所得税的计算可能因个人情况而异，如是否有其他收入、额外的专项扣除等。建议咨询专业税务人员或使用相关税务软件进行精确计算。
• 遵守国家税收法规，按时足额缴纳税款，避免产生税务风险。

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