以欺骗手段获取规划许可被撤销后，厂房确实存在被认定为违法建筑的风险，但具体是否会被认定，还需结合多种因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律背景与规定

1. 规划许可的法律效力：规划许可是建设行为合法性的重要依据。根据《城乡规划法》等相关法律法规，建设单位或个人必须按照规划许可的内容进行建设，未经许可或违反许可内容进行建设的，均属于违法行为。

2. 欺骗手段获取许可的法律后果：如果建设单位或个人通过欺骗手段获取规划许可，该许可自始无效。一旦被发现，规划部门有权撤销该许可，并可能对相关责任人进行处罚。

二、厂房被认定为违法建筑的可能性

1. 许可被撤销后的法律状态：规划许可被撤销后，基于该许可进行的建设行为即失去了合法依据。此时，如果厂房的建设违反了城乡规划或相关法律法规，那么该厂房就有可能被认定为违法建筑。

2. 认定违法建筑的标准：认定违法建筑通常需要考虑多个因素，包括但不限于建设行为是否违反了城乡规划、是否取得了必要的建设许可、是否符合建筑安全标准等。如果厂房的建设完全符合这些标准，只是因为规划许可被撤销而被认定为违法建筑，那么这种认定可能存在争议。但在大多数情况下，规划许可的撤销会成为认定违法建筑的重要依据。

三、可能面临的法律后果

1. 行政处罚：如果厂房被认定为违法建筑，建设单位或个人可能面临行政处罚，包括罚款、责令拆除等。这些处罚措施旨在纠正违法行为，恢复城乡规划的秩序。

2. 民事赔偿：如果厂房的建设行为给第三方造成了损失，如相邻建筑物的损坏、土地使用权的侵害等，建设单位或个人还可能面临民事赔偿的责任。

四、建议与应对措施

1. 及时咨询专业律师：面对这种情况，建议建设单位或个人及时咨询专业律师，了解具体的法律风险和应对措施。律师可以根据具体情况提供法律意见，帮助当事人维护合法权益。

2. 积极配合调查与处理：如果规划部门已经启动了对厂房的调查程序，建设单位或个人应积极配合调查工作，提供必要的证据和资料。同时，也可以主动与规划部门沟通协商，寻求合理的解决方案。

3. 考虑申请复议或诉讼：如果对规划部门的撤销决定或违法建筑的认定有异议，建设单位或个人可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，通过法律途径维护自己的权益。

总结来说，以欺骗手段获取规划许可被撤销后，厂房确实存在被认定为违法建筑的风险。但具体是否会被认定以及可能面临的法律后果，还需结合多种因素综合判断。因此，建议建设单位或个人及时咨询专业律师，了解具体的法律风险和应对措施。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。