纳税人违法行为的管辖通常根据违法行为的性质、情节以及涉及的税种等因素，由相应的税务机关或司法机关进行管辖。以下是对此问题的详细分析：

一、税务机关管辖

1. 一般违法行为：

   • 对于纳税人的轻微违法行为，如未按照规定期限办理纳税申报、未按照规定设置账簿等，通常由主管税务机关进行管辖。税务机关会依据相关税收法律法规，对纳税人进行税务行政处罚，如罚款、加收滞纳金等。

2. 偷税、逃税等严重违法行为：

   • 对于纳税人的偷税、逃税等严重违法行为，税务机关在初步调查后，如果认为涉嫌犯罪，会依法将案件移送至司法机关（如公安机关）进行刑事侦查和起诉。在此之前，税务机关也会进行税务行政处理，如追缴税款、加收滞纳金和罚款等。

二、司法机关管辖

1. 刑事犯罪管辖：

   • 当纳税人的违法行为涉嫌构成犯罪时，如偷税罪、逃税罪等，案件将由司法机关进行管辖。公安机关负责刑事侦查，检察院负责提起公诉，法院负责审判。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，对于构成犯罪的纳税人，将依法追究其刑事责任。

2. 民事纠纷管辖：

   • 在某些情况下，纳税人的违法行为可能引发民事纠纷，如因偷税、逃税等行为导致的债权债务纠纷。这类纠纷通常由法院进行管辖，通过民事诉讼程序解决。

三、特殊情况的管辖

1. 跨地区违法行为：

   • 对于跨地区的纳税人违法行为，如跨地区偷税、逃税等，可能涉及多个税务机关的管辖。在这种情况下，通常由共同的上级税务机关协调指定管辖，或者由相关税务机关联合进行调查和处理。

2. 国际税收违法行为：

   • 对于涉及国际税收的纳税人违法行为，如跨国偷税、逃税等，可能涉及国际税收合作和司法协助。在这种情况下，案件的管辖可能涉及多个国家的税务机关和司法机关，需要依据国际税收协定和相关法律法规进行协调和处理。

四、法律建议

1. 遵守税收法律法规：

   • 纳税人应严格遵守税收法律法规，按时、如实进行纳税申报和缴纳税款，避免违法行为的发生。

2. 及时咨询专业意见：

   • 对于复杂的税务问题或不确定的纳税义务，纳税人应及时咨询专业的税务律师或会计师，以确保合规纳税并降低法律风险。

3. 积极配合税务机关调查：

   • 如果纳税人的违法行为被税务机关发现并调查，应积极配合税务机关的工作，如实提供相关资料和情况说明，以争取从轻或减轻处理。

如有任何关于纳税人违法行为管辖的具体问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答和建议。