关于在工厂填写先进工作者材料时有涂改，档案能否认定的问题，这主要取决于涂改的性质、程度以及工厂的相关规定和档案管理要求，以下分情况讨论：
轻微涂改且不影响材料真实性：
- 如果涂改只是轻微的笔误修正，比如错别字、日期的小调整等，且这些涂改并不影响材料整体的真实性和准确性，那么一般来说，这样的涂改不会影响档案的认定。工厂在审核材料时，会综合考虑材料的整体内容和涂改的性质，如果认为涂改不影响材料的真实性，通常会予以认定。
涂改涉及关键信息且未说明原因：
- 如果涂改涉及到了材料中的关键信息，如姓名、工作成果、获奖情况等，且没有合理的解释或说明，那么这可能会引起工厂对材料真实性的质疑。在这种情况下，工厂可能会要求提供进一步的证明材料或进行调查，以确认材料的真实性。如果无法提供充分的证明或调查结果不支持材料的真实性，那么档案可能不会被认定。
涂改违反工厂规定或档案管理要求：
- 有些工厂可能有明确的规定，禁止对提交的材料进行任何形式的涂改。如果违反了这些规定，即使涂改的内容并不影响材料的真实性，工厂也可能因为规定而拒绝认定档案。此外，档案管理也有其特定的要求和标准，如果涂改违反了这些要求，也可能导致档案不被认定。
法律建议：
- 保持材料整洁：在填写任何材料时，都应尽量保持整洁，避免不必要的涂改。如果确实需要修改，最好使用划线更正的方式，并在旁边注明修改的原因和日期。
- 了解工厂规定：在提交材料前，应了解工厂的相关规定和档案管理要求，确保自己的材料符合这些要求。
- 及时沟通解释：如果材料中有涂改，且可能引起质疑，应及时与工厂相关部门沟通解释，提供必要的证明材料或说明情况。
可能后果：
- 如果档案因涂改而不被认定，可能会影响到个人的先进工作者评选、晋升、奖励等权益。因此，在填写和提交材料时，应格外谨慎。
总结：档案能否因涂改而被认定，取决于涂改的性质、程度以及工厂的相关规定和档案管理要求。为了避免不必要的麻烦和损失，建议在填写材料时保持整洁、了解规定、及时沟通解释。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。