关于医院让助理医师接诊是否合法的问题，这需要根据具体的法律法规和实际情况来综合判断。

首先，我们要明确的是，执业助理医师在执业医师的指导下，是可以在医疗卫生机构中按照注册的执业类别、执业范围执业的。这是《中华人民共和国医师法》第三十四条第一款的明确规定。这意味着，助理医师并不具备独立执业的资格，他们必须在执业医师的监督和指导下进行工作。

然而，在实际操作中，有些医院或诊所可能会出于成本控制、人员短缺等原因，安排助理医师独立接诊。这种行为是违法的，因为它违反了上述的法律规定。如您提供的参考信息中所述，常熟市某诊所就因使用执业助理医师在无执业医师的指导下独立为患者提供诊疗服务，而受到了严厉的行政处罚，包括警告、罚款以及撤销备案等。

此外，国家卫生健康委等部门也一直在加强对医疗机构医疗质量的监管，严厉打击包括助理医师独立执业在内的各种违法行为。例如，近期郑州市卫生监督部门就连续查处了多起中医馆违规事件，其中就涉及到了人员资质不全的问题。

因此，医院让助理医师独立接诊是不合法的。这种行为不仅违反了法律法规，也严重威胁到了患者的生命安全和健康权益。医疗机构应该严格遵守相关法律法规，确保助理医师在执业医师的指导下进行工作，以保障医疗质量和患者安全。

如果您在实际就医过程中遇到了类似的问题，建议您及时向当地的卫生监督部门进行举报和投诉，以维护自己的合法权益。同时，也希望医疗机构能够加强自律，严格遵守相关法律法规，为患者提供更加安全、有效的医疗服务。