合作方因另一方代发工资而要求开具发票是合法的，但需满足特定条件并遵循相关流程。以下从不同角度进行分析：

1. 代发工资的性质与发票开具的合法性
   代发工资本质上是委托方（实际用工单位）与受托方（代发方）之间的委托合同关系。根据《民法典》第九百一十九条，委托合同是委托人和受托人约定，由受托人处理委托人事务的合同。若合作中明确约定由一方代发工资，且该行为属于合作内容的一部分（如劳务外包、人力资源服务等），则代发方有权要求委托方按照实际支付的工资金额开具发票。
   合法性依据：根据《发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。代发工资若属于合作中的服务内容（如人力资源服务费），则符合开具发票的条件。

2. 代发工资是否属于应税行为
   需区分代发工资的性质：

   • 若代发方仅作为“转账通道”：即委托方将工资款转至代发方账户，由代发方原封不动转发给员工，且代发方不收取任何费用（如手续费、服务费），则此行为不属于增值税应税行为，无需开具发票。
     
   • 若代发方提供额外服务并收费：例如代发方负责工资核算、个税申报、社保代缴等，并收取服务费，则该服务属于“人力资源服务”或“经纪代理服务”，需按照6%的税率（一般纳税人）或3%的征收率（小规模纳税人）缴纳增值税，并开具相应发票。
     

3. 实务操作中的注意事项

   • 合同约定：合作双方应在合同中明确代发工资的具体内容（如是否包含服务费、费用标准等），避免因约定不清引发纠纷。
     
   • 税务合规：代发方若需开具发票，应确保自身具备开具发票的资格（如办理税务登记、领用发票等），并按照实际服务内容选择正确的税目和税率。
     
   • 个税处理：代发工资时，实际用工单位仍需履行个税代扣代缴义务，代发方仅作为转账方，不承担个税责任（除非合同另有约定）。
     

建议：若合作中涉及代发工资并需开具发票，双方应提前协商明确服务内容、费用及税务处理方式，并在合同中详细约定。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程或税务合规问题。