结论：强制执行阶段未申请违约金，后期能否再申请需分情况讨论，具体如下：

1. 若原生效法律文书（如判决书、调解书）已明确违约金数额或计算方式
   根据《民事诉讼法》第2六十条，执行依据是已生效的法律文书。若文书内容已包含违约金条款（如“逾期支付需按日万分之五支付违约金”），则违约金属于法律文书确定的债务范围。此时：

   • 执行阶段未申请违约金：若在首次执行程序中未将违约金列入申请执行标的，可视为对自身权利的暂时放弃，但不影响后续申请。
     
   • 后期申请方式：需向法院提交《恢复执行申请书》或《追加执行标的申请书》，附上原法律文书及违约金计算明细，法院审查后会将违约金纳入执行范围。
     
   • 关键点：需在执行时效内（通常为2年，自法律文书规定履行期限最后一日起算）提出申请，否则可能丧失执行权利。

2. 若原生效法律文书未明确违约金，但合同中有约定
   若原判决仅支持本金及利息，未涉及违约金，但双方合同中约定了违约金条款（如“违约方需支付合同总价20%的违约金”），则需分两步处理：

   • 第一步：另行起诉主张违约金：因违约金不属于原判决范围，需通过新诉讼确认违约金数额。需提交合同、违约证据（如对方逾期履行证明）等材料，法院判决后获得新的执行依据。
     
   • 第二步：申请强制执行新判决：拿到违约金判决后，可单独申请执行该部分金额，与原判决的执行程序互不影响。
     
   • 风险提示：若合同未约定违约金，或约定不明确（如仅写“赔偿损失”），法院可能根据实际损失酌情调整，甚至不支持违约金主张。

3. 若执行过程中双方达成和解协议
   若在执行阶段与被执行人签订《执行和解协议》，明确放弃或暂缓主张违约金，则需按协议履行：

   • 若协议未约定违约金：后期不得再以原合同为由申请违约金，否则构成违约（需承担和解协议中的违约责任）。
     
   • 若协议保留违约金权利（如“待某条件成就后支付违约金”）：可在条件成就后，依据和解协议申请执行违约金部分。

行动建议：

• 立即核查原法律文书及合同条款，确认违约金是否已明确；
  
• 若已明确但未申请，尽快向法院提交追加执行标的申请；
  
• 若未明确，需评估另行起诉的可行性（如证据是否充分、诉讼成本等）；
  
• 涉及复杂情况（如和解协议、时效争议），建议携带材料面谈，以便精准分析。
  

（如有具体文书或合同条款，可进一步提供细节，我会帮你制定更详细的方案。）