针对您提出的“就业协议书里面两个章其中有一个章盖的不是特别明显”的问题，这确实是一个需要细致处理的情况，因为就业协议书对于毕业生、用人单位和学校三方都具有重要的法律效应。以下是我为您提供的详细解答和建议：

首先，我们需要明确就业协议书的重要性。就业协议书，俗称“三方协议”，是明确毕业生、用人单位、毕业生所在学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的重要文件。它具有一定的广泛性和权威性，对签约的三方都有约束力。因此，协议书上的每一个章都代表着相应方的认可和承诺，必须清晰、明确。

针对您提到的一个章盖得不是特别明显的情况，我建议您采取以下步骤：

1. 确认盖章情况：

   • 仔细检查就业协议书，确认是哪个章盖得不清楚。
   • 判断这个不清楚的章是用人单位的章还是学校的章，因为不同方的处理方式可能略有不同。

2. 联系盖章方：

   • 如果是用人单位的章盖得不清楚，建议您尽快与用人单位的人力资源部门或相关负责人联系，说明情况，并请求他们重新盖章或提供盖章清晰的复印件。
   • 如果是学校的章盖得不清楚，您可以联系学校的就业指导中心或相关负责老师，同样说明情况，并请求他们协助处理。

3. 重新盖章或确认：

   • 在与盖章方沟通后，根据他们的指示，可能需要您将就业协议书寄回给他们重新盖章，或者他们提供盖章清晰的复印件给您。
   • 如果重新盖章不可行，您可以请求盖章方出具一份书面说明，确认该章的有效性，并加盖他们清晰的公章作为佐证。

4. 保留证据：

   • 在整个处理过程中，建议您保留好所有与盖章方的沟通记录，如邮件、短信、电话录音等，以备不时之需。

5. 提交审核：

   • 在您获得盖章清晰或得到盖章方书面说明的就业协议书后，按照学校或相关部门的审核流程，将协议书提交进行审核。

最后，我想强调的是，就业协议书是您就业过程中的重要法律文件，必须确保其完整性和清晰性。如果遇到任何问题或不确定的情况，建议您及时咨询学校就业指导中心或相关法律专业人士的意见，以确保您的权益得到保障。

希望以上解答和建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。