关于您提出的“公司借款借条只盖公章是否有效”的问题，这确实是一个涉及法律效力和实际操作的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、借条上只有公章的有效性判断
法律规定基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同（包括借条）的成立通常需要当事人签名、盖章或按指印。加盖公章，作为法人行为的一种表现，通常意味着法人对合同内容的认可。
公章的真实性与合法性：
- 借条上加盖的公章必须是公司的合法有效印章。如果公章是伪造、盗用或无效的，那么借条的效力可能会受到影响。因此，在签订借条时，务必核实公章的真实性。
借款行为的合规性：
- 借款行为必须符合公司的内部规定和法律法规。例如，借款金额是否超出公司规定的范围，是否经过相应的审批流程等。如果借款行为本身存在违规情况，那么借条的效力也可能会受到质疑。
借条内容的完整性：
- 借条上应明确记载借款人和出借人的信息、借款金额、借款时间、还款时间等关键要素。如果借条内容不完整或存在瑕疵，可能会影响其法律效力。
二、实际操作建议
确保公章真实有效：
- 在签订借条前，务必核实公章的真实性和合法性，避免使用伪造或盗用的公章。
完善借条内容：
- 借条上应详细记录借款人和出借人的信息、借款金额、利息（如有）、还款时间等关键条款，以确保借条内容的完整性和明确性。
遵守公司规定：
- 了解并遵守公司的借款规定，确保借款行为符合公司内部的审批流程和金额限制等要求。
考虑法人签字：
- 虽然仅有公章的借条在多数情况下可能有效，但为了进一步降低法律风险，建议同时要求法人亲笔签字并加盖公章。这样做可以增强借条的法律效力，确保双方权益得到充分保障。
三、特殊情况说明
- 如果实际借款人是个人，而仅在借条上加盖了单位公章，且单位并无借款的真实意思表示，同时出借人对此明知，那么还款责任主体仍为个人，单位无需承担还款责任。
总结：
借条上只有公章没有法人签字的有效性需根据具体情况综合判断。在借条内容真实合法、公章真实有效且借款行为符合公司规定的情况下，通常认为借条是有效的。然而，为了确保借条的法律效力和严谨性，建议同时要求法人签字并加盖公章，并完善借条内容。在实际操作中，应谨慎处理借条的签订和审核工作，以确保双方权益得到充分保障。