面对农村邻里侵占农田的问题，这确实是一个需要谨慎且合法处理的情况。为了确保您的权益得到妥善维护，我建议您按照以下步骤来操作：
一、优先尝试协商和调解
主动与邻居沟通：
- 首先，您可以尝试与邻居进行友好、冷静的对话，明确指出其侵占农田的行为对您造成的困扰和损失。
- 要求邻居立即停止侵占，并恢复土地到原来的状态。在沟通过程中，保持礼貌和理性，避免情绪化的言辞导致矛盾升级。
寻求第三方调解：
- 如果直接沟通没有效果，您可以考虑邀请村里有威望的长辈、村民委员会或者专业的调解机构来介入。
- 这些第三方通常具有中立性，能够帮助双方更好地理解彼此立场，提出合理的解决方案，并促使双方达成和解。
二、向政府部门申请处理
向乡镇人民政府或街道办事处反映：
- 根据相关法律法规，土地所有权和使用权争议可以由乡级人民政府或县级以上人民政府处理。
- 您可以向乡镇人民政府或街道办事处的相关部门提交书面材料，详细描述侵占情况，包括时间、地点、侵占面积等，并请求他们进行调查和处理。
向县级以上自然资源主管部门举报：
- 如果邻居的侵占行为涉及违法用地，比如未经批准擅自改变土地用途，那么您应该向县级以上自然资源主管部门进行举报。
- 该部门有权对土地违法行为进行查处，包括责令停止违法行为、恢复土地原状，并依法给予相应的处罚。
三、考虑法律诉讼途径
提起民事诉讼：
- 如果协商和政府部门处理都没有解决问题，您可以准备充分的证据，如土地权属证明、侵占现场的照片或视频、证人证言等，向人民法院提起民事诉讼。
- 在诉讼中，您可以要求邻居停止侵权行为，恢复土地原状，并赔偿因侵占行为给您造成的损失。
提起行政诉讼（如适用）：
- 如果您对政府部门的处理决定不满意，认为其未依法履行职责或处理结果不公正，您可以在规定期限内向上一级人民政府或人民法院提起行政诉讼。
四、注意事项
- 在整个处理过程中，务必保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语，以免加剧矛盾。
- 收集证据时，要确保证据的合法性、真实性和关联性，以便在需要时能够有力地支持您的主张。
- 如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以考虑咨询专业律师，以获得更具体的指导和帮助。
综上所述，面对农村邻里侵占农田的问题，您应该优先通过协商和调解来解决；如果协商无果，再依法向政府部门申请处理或采取法律诉讼途径来维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。