当营运车辆遭遇撞车事故时，处理流程及赔偿问题确实相对复杂，但只要按照以下步骤逐一进行，就能有效维护自身权益。

一、确保安全与现场处理

1. 确保人员安全：首要任务是确保所有人员的安全，迅速打开危险警示灯，并在车辆后方适当距离放置三角警示标志，以防止二次事故。
2. 紧急救助：检查是否有人员伤亡，如有需要，立即拨打120急救电话。
3. 报警与记录：拨打122交通事故报警电话，同时详细记录事故发生的时间、地点、肇事车辆及人员信息。拍摄现场照片，包括车辆受损情况、周围环境、交通信号灯状态等，这些照片将作为后续处理的重要证据。
4. 目击者信息：如果条件允许，寻找目击者并留下他们的联系方式，以便后续需要时能请他们作证。

二、配合交警调查与责任认定

1. 积极配合交警：如实向交警陈述事故经过，不得隐瞒或提供虚假信息。
2. 获取责任认定书：等待交警出具交通事故责任认定书，这份认定书将明确各方责任比例，是后续赔偿处理的重要依据。

三、通知保险公司与定损理赔

1. 及时报案：向自己的保险公司报案，告知事故详情，并提醒对方车主也通知其保险公司。
2. 详细定损：配合保险公司定损员对车辆进行全面评估，确保所有损失，包括车辆维修费用、货物损失（如有）、车辆贬值损失（如经评估）等，均被准确记录。
3. 选择正规维修厂：选择具有资质的正规维修厂进行维修，并保存好维修记录和费用发票。
4. 理赔协商：根据责任认定结果，与保险公司和对方当事人协商理赔事宜，确保赔偿金额合理且覆盖所有损失。

四、索赔营运损失

1. 收集证据：准备营运许可证、事故前后的营运收入记录、维修时间证明等证据，以证明因事故导致的营运损失。
2. 提出索赔：向对方保险公司明确提出营运损失的赔偿要求，并提交相关证据。如果对方保险公司拒绝赔偿或赔偿金额不合理，可以进一步协商或通过法律途径解决。

五、法律途径解决纠纷

1. 律师咨询：在赔偿问题上存在分歧时，寻求专业律师的咨询，了解自身权益和法律责任。
2. 发送律师函：若协商无果，可委托律师向对方发送律师函，敦促其履行赔偿责任。
3. 提起诉讼：若律师函未能解决问题，可向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，提供充分证据支持自己的主张。

六、预防与总结

1. 加强安全意识：对事故原因进行深入分析，加强驾驶技能和安全意识，以减少未来类似事故的发生。
2. 定期车辆维护：定期对车辆进行检查和维护，确保车辆安全性能良好，降低事故风险。

在处理营运车辆撞车事故时，务必保留好所有相关证据，包括事故责任认定书、维修票据、营运收入流水等。这些证据将在后续的理赔和诉讼过程中发挥关键作用。同时，积极与保险公司和对方当事人协商，寻求合理赔偿。如果协商无果，不要犹豫，及时寻求法律途径解决纠纷，以维护自身合法权益。