在现场安全检查后，如果主要负责人拒绝在检查记录上签字，可以采取以下措施：

1. 记录拒绝签字的情况：

   • 检查人员应当在检查记录上详细注明主要负责人拒绝签字的情况，包括拒绝签字的时间、地点、在场人员以及拒绝签字的理由（如果有提供）。这一步骤至关重要，因为它为后续的法律程序或争议解决提供了关键证据。

2. 邀请见证人签字：

   • 如果可能，检查人员可以邀请其他在场人员（如其他负责人、员工或第三方）作为见证人在检查记录上签字。见证人的签字可以增强检查记录的证明力，表明检查过程是公开、透明的，且主要负责人确实拒绝签字。

3. 通过其他方式确认检查事实：

   • 除了检查记录外，检查人员还可以通过拍照、录像等方式记录检查现场的情况，以及主要负责人拒绝签字的过程。这些视听资料可以作为辅助证据，进一步证明检查事实和主要负责人的拒绝行为。

4. 法律后果与应对措施：

   • 法律后果：主要负责人拒绝在检查记录上签字，并不影响检查记录的效力。检查记录仍然可以作为行政机关作出行政处罚或其他行政行为的依据。然而，如果主要负责人因此否认检查事实或拒绝配合后续的法律程序，可能会面临更严重的法律后果，如被认定为妨碍公务等。
   • 应对措施：如果主要负责人拒绝签字且后续不配合，行政机关可以依法采取强制措施或申请法院强制执行。同时，行政机关还可以将主要负责人的拒绝行为记录在案，作为对其信用评价或行政处罚的参考依据。

5. 建议与沟通：

   • 在采取上述措施的同时，检查人员也可以尝试与主要负责人进行沟通，解释签字的重要性以及拒绝签字的法律后果。通过沟通，可能能够化解误解或矛盾，促使主要负责人自愿签字。

行动建议：

• 在处理此类情况时，检查人员应保持冷静和专业，避免与主要负责人发生冲突或争执。
• 确保所有记录和证据都完整、准确，并妥善保存以备后续使用。
• 如果主要负责人持续拒绝签字且不配合后续程序，建议及时咨询法律专业人士或向上级行政机关报告，以便采取更进一步的法律措施。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供专业的法律意见。