若遇到刑事案件中公安机关存在地方保护的情况，可通过以下途径处理：
向上级公安机关反映
- 法律依据：根据《公安机关办理刑事案件程序规定》，上级公安机关对下级公安机关的执法活动有监督、指导的职责。当认为下级公安机关在办理刑事案件过程中存在地方保护等不当行为时，有权进行纠正。
- 操作方式：可以向上一级公安机关的法制部门、督察部门等反映情况。反映时需要提供详细的证据材料，如案件相关的文件、证人证言、现场记录等，以证明公安机关存在地方保护的行为。例如，如果公安机关对本地犯罪嫌疑人采取宽松的执法措施，而对外地犯罪嫌疑人则过度执法，就可以收集相关的执法记录、处理结果等证据。
- 可能的结果：上级公安机关经过调查核实后，如果确认存在地方保护行为，会责令下级公安机关纠正，并对相关责任人员进行内部处理。
向人民检察院反映
- 法律依据：人民检察院是国家的法律监督机关，对公安机关的侦查活动是否合法进行监督。根据《刑事诉讼法》规定，人民检察院认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查的，或者被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查，向人民检察院提出的，人民检察院应当要求公安机关说明不立案的理由。人民检察院认为公安机关不立案理由不能成立的，应当通知公安机关立案，公安机关接到通知后应当立案。同时，对于公安机关在侦查过程中的其他违法行为，人民检察院也有权进行监督纠正。
- 操作方式：可以向同级人民检察院的侦查监督部门反映公安机关存在地方保护的情况。同样需要提供充分的证据材料，如案件的受理情况、侦查进展、公安机关的处理方式等。例如，如果公安机关对涉及本地企业的犯罪案件拖延侦查，而对其他类似案件迅速处理，就可以提供相关的案件受理时间、侦查进度对比等证据。
- 可能的结果：人民检察院经过调查后，如果发现公安机关存在地方保护等违法行为，会发出纠正违法通知书，要求公安机关改正。如果情节严重，还可能对相关责任人员追究法律责任。
申请行政复议或提起行政诉讼（针对具体行政行为）
- 适用情况：如果公安机关的地方保护行为表现为具体的行政行为，如对案件的管辖决定、强制措施的采取等，当事人认为这些行政行为侵犯了其合法权益，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
- 操作方式：
- 行政复议：一般向作出具体行政行为的公安机关的上一级公安机关或者同级人民政府申请行政复议。申请时需要提交行政复议申请书，说明申请复议的事实、理由和请求，并提供相关的证据材料。
- 行政诉讼：向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。起诉时需要提交起诉状，明确被告、诉讼请求、事实和理由等，并附上相关证据。
- 可能的结果：行政复议机关或人民法院经过审理后，如果认为公安机关的具体行政行为违法，会撤销、变更或者确认该行政行为违法，并可以责令公安机关重新作出具体行政行为。
借助媒体和社会监督力量
- 操作方式：在合法合规的前提下，可以通过合法的媒体渠道反映公安机关存在地方保护的情况，引起社会的关注和监督。但需要注意，反映的情况必须真实可靠，不得捏造事实或夸大其词。
- 可能的结果：媒体的报道和社会的关注可能会促使公安机关重视问题，主动纠正不当行为。同时，也可能引起相关部门的重视，推动问题的解决。不过，这种方式应谨慎使用，避免对案件的办理造成不必要的干扰。