结论：非法传唤后签订调解协议，仍然可以就非法传唤的行为申请行政复议。
分析说明：
行政复议的独立性：
- 行政复议是公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益时，依法向有复议权的行政机关提出申请，由受理申请的行政机关对原具体行政行为依法进行审查并作出决定的活动。
- 行政复议的申请并不受后续签订调解协议的影响，因为调解协议主要解决的是因非法传唤可能引发的民事纠纷或行政赔偿等问题，而行政复议则是对行政机关具体行政行为的合法性进行审查。
非法传唤的复议权利：
- 非法传唤属于行政机关的具体行政行为，如果公民认为该行为侵犯了其合法权益，有权依法申请行政复议。
- 签订调解协议并不意味着公民放弃了就非法传唤行为申请行政复议的权利。调解协议通常只涉及因非法传唤造成的损失赔偿、道歉等民事或行政赔偿方面的内容，并不涉及对非法传唤行为本身的合法性审查。
调解协议与行政复议的关系：
- 调解协议是双方自愿达成的，用于解决特定争议或纠纷的协议。它并不具有排除或限制公民申请行政复议的效力。
- 如果公民在签订调解协议后，仍然认为非法传唤行为违法，并希望对此进行法律救济，可以依法向有复议权的行政机关提出行政复议申请。
法律建议：
- 如果您认为遭遇了非法传唤，并希望就此申请行政复议，即使已经签订了调解协议，也仍然可以依法提出申请。
- 在申请行政复议时，建议您准备充分的证据材料，如传唤证、现场照片、视频、证人证言等，以证明非法传唤的事实和您的合法权益受到了侵犯。
- 同时，您也可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助，确保您的复议申请能够得到有效处理。
后续行动提示：
- 如果您决定申请行政复议，请尽快向有复议权的行政机关提出申请，并按照要求提交相关证据材料。
- 在复议过程中，保持与复议机关的沟通，及时了解复议进展情况，并根据需要补充或提供新的证据材料。
- 如果对复议结果不满意，您还可以依法向人民法院提起行政诉讼，以进一步维护自己的合法权益。