结论：小三把钱退回来后，原配是否还能起诉，取决于多个具体因素，包括退还金额是否足额、是否存在其他法律责任、退还过程是否存在争议、诉讼时效以及证据的充分性等。以下是对这些因素的详细分析：
可以起诉的情况
退还金额不足：
- 如果小三退回的钱款并未完全覆盖原配因配偶出轨赠与行为所遭受的财产损失，原配仍有权向法院起诉，要求小三返还剩余的涉及夫妻共同财产部分。这一权利基于法律对夫妻共同财产的保护，确保原配的合法权益不受侵害。
- 举例：假设老公未经原配同意，擅自将10万元夫妻共同财产赠与小三，小三仅退还了5万元，那么原配仍有权起诉要求小三返还剩余的5万元。
存在其他法律责任：
- 即便小三已退回全部款项，但如果其行为构成欺诈、胁迫等违法行为，或者给原配造成了精神损害等其他损失，原配依然可以依法起诉，追究小三的相应法律责任，并要求其承担精神损害赔偿等民事责任。
- 举例：如果小三通过欺诈手段获取财物，或者其出轨行为给原配造成了严重的精神损害，原配可以起诉要求小三承担相应的法律责任。
退还过程存在争议：
- 在退还过程中，如果双方对退还金额的计算有分歧，或者小三获取财物的方式涉嫌违法犯罪，原配同样有权向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
- 举例：如果双方对退还金额的计算存在争议，或者小三获取财物的方式涉嫌盗窃、诈骗等犯罪行为，原配可以起诉要求法院进行裁决或追究小三的刑事责任。
难以起诉的情况
足额退还且无其他诉求：
- 如果小三已经足额退还了涉及的财产，且原配没有其他明确的诉求和证据来支持进一步的法律主张，那么起诉可能难以获得法院的支持。在这种情况下，原配的权益已经得到了恢复，再行起诉缺乏法律依据。
基于自愿协商的退还：
- 如果小三的退还行为是基于双方自愿协商的结果，而非法律义务，那么原配起诉往往也会缺乏法律依据。法院通常会尊重双方的意愿，不会轻易介入。
其他重要考虑因素
诉讼时效：
- 根据法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间一般为三年。原配需要在这一期限内提起诉讼，否则将可能丧失胜诉权。因此，原配在决定是否起诉时，应充分考虑诉讼时效的问题。
证据充分性：
- 起诉需要充分的证据来支持主张。原配需要收集能够证明小三获取财物的不正当性、具体数额以及自身受损失的证据。如果证据不足或无法形成完整的证据链，那么起诉可能难以成功。
- 建议：原配在起诉前应尽可能收集转账记录、聊天记录、通话录音等证据，以证明小三获取财物的不正当性和具体数额。
总结与建议：小三把钱退回来后，原配是否能起诉需根据具体情况来判断。在决定起诉前，原配应全面评估自己的权益受损情况、证据充分性以及诉讼时效等因素。如果原配认为自己的权益受到了侵害，且证据充分、诉讼时效未过，那么可以考虑向法院提起诉讼以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。