女职工在产假期间，其奖金是否应被扣除需根据奖金的性质、公司制度及法律规定来综合判断，但原则上不应因生育而降低其待遇，包括奖金。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律原则与规定
不得因生育降低待遇原则：
- 根据《女职工劳动保护特别规定》第五条，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或解除劳动（聘用）合同。此处的“工资”应理解为包含基本工资、岗位工资及常规性劳动报酬部分，对于奖金的涵盖，虽未直接提及，但根据工资总额的组成，奖金通常也被视为工资的一部分。
- 《中华人民共和国劳动法》第五十一条同样强调，女职工在产假期间的合法权益应得到保障，这包括工资及奖金等劳动报酬。
生育保险与工资支付：
- 已参加生育保险的女职工，产假期间的生育津贴由生育保险基金按用人单位上年度职工月平均工资标准支付，此“工资”理应包含奖金部分。
- 未参加生育保险的女职工，产假期间的工资由用人单位按产假前工资标准支付，同样应包括奖金。
国家统计局规定：
- 工资总额包括各单位直接支付给职工的劳动报酬总额，其中明确包含奖金。因此，从广义上讲，奖金作为工资的一部分，在产假期间不应被扣除。
二、奖金性质与公司制度考量
奖金作为固定工资组成部分：
- 若公司薪酬制度中明确规定奖金为工资的固定组成部分，如每月或每年有固定金额或比例的奖金发放，则产假期间不应扣除这部分奖金。否则，将违反“不得因生育降低待遇”的原则。
基于绩效考核的奖金：
- 若奖金与绩效考核挂钩，需根据实际情况处理。女职工产假期间未实际工作，无相应工作业绩的，公司可根据绩效考核结果决定奖金发放情况。但若女职工在产假前已完成工作任务并达到绩效考核标准，仅因休产假而未能在考核期继续工作，公司应按其之前的工作表现和业绩发放相应奖金。
基于出勤情况的奖金：
- 如全勤奖等基于出勤的奖金，由于女职工产假期间无法正常出勤，通常不会发放这类奖金。但这并不违反法律规定，因为此类奖金本就基于出勤条件设定。
三、特殊情况与协商建议
- 对于特殊情况下的奖金发放，如女职工在产假前后对项目的贡献、公司政策的调整等，建议女职工与用人单位进行协商，以达成公平合理的解决方案。
- 女职工在休产假前应主动与用人单位沟通相关待遇问题，确保自己的权益得到明确和保障。
- 如遇用人单位违法扣除产假期间奖金的情况，女职工可依法寻求法律援助或向相关部门投诉维权。
总结来说，女职工在产假期间的奖金是否应被扣除，需综合考虑奖金的性质、公司制度及法律规定。在大多数情况下，奖金作为工资的一部分，不应因生育而被扣除。但若奖金与特定条件（如出勤、绩效考核）挂钩，且女职工在产假期间无法满足这些条件，则可能不发放相应奖金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。