结论：面对父亲古灰盒被小三从墓地偷走的情况，你可以从民事侵权、刑事报案以及协商调解三个角度来处理。

1. 民事侵权角度：

   • 法律依据：根据《民法典》的相关规定，公民的合法权益受法律保护，任何组织或者个人不得侵犯。古灰盒作为逝者的遗物，承载着家属的情感和纪念价值，属于公民的合法权益范畴。小三偷走古灰盒的行为，侵犯了家属的合法权益，构成民事侵权。
   • 处理方式：你可以向法院提起民事诉讼，要求小三返还古灰盒，并赔偿因此造成的精神损害抚慰金等损失。在诉讼过程中，你需要提供相关证据，如墓地管理方的证明、监控录像、报警记录等，以证明小三的侵权行为和你的损失。

2. 刑事报案角度：

   • 法律依据：如果小三偷走古灰盒的行为情节严重，如涉及多次盗窃、盗窃后销毁或藏匿等，可能构成盗窃罪或其他相关犯罪。根据《刑法》的相关规定，盗窃公私财物，数额较大的，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。
   • 处理方式：你可以向当地公安机关报案，提供相关证据和线索，要求公安机关立案侦查。如果公安机关认为符合立案条件，将会展开调查，并依法追究小三的刑事责任。

3. 协商调解角度：

   • 处理方式：在采取法律手段之前，你也可以尝试与小三进行协商调解。通过沟通，了解她偷走古灰盒的动机和目的，尝试通过和平的方式解决问题。如果小三愿意归还古灰盒并道歉，你可以考虑不再追究其法律责任。但需要注意的是，协商调解并不意味着放弃法律权利，如果协商无果或小三再次侵犯你的权益，你仍然可以采取法律手段来维护自己的合法权益。

额外建议：

• 在处理此类事件时，保持冷静和理智至关重要。避免与小三发生直接冲突或暴力行为，以免事态升级或造成不必要的伤害。
• 及时收集并保存相关证据，如监控录像、报警记录、证人证言等，以便在后续的法律程序中证明自己的权益和对方的侵权行为。
• 如果对法律程序不熟悉或感到无助，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。

面对这种情况，你有多种处理方式可供选择。希望这些建议能对你有所帮助，如果你有任何进一步的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。