核心结论：员工面对单位倒查半年考勤查出严重违反规章制度的情况，可从积极沟通协商、核查单位处理程序合法性、准备证据应对不利处理、考虑法律救济途径这几个方面来处理。以下是具体情况分析：
积极与单位沟通协商
- 了解具体情况：员工首先要主动与单位的人力资源部门或相关负责人取得联系，了解单位倒查考勤的具体原因、依据以及所认定的严重违反规章制度的具体行为表现。例如，单位是依据哪一条规章制度认定员工严重违规，考勤记录显示员工具体有哪些缺勤、迟到早退等情况。
- 解释说明情况：如果员工认为自己并不存在严重违反规章制度的行为，或者存在一些特殊情况导致考勤异常，如因不可抗力因素（突发重大疾病、遭遇意外事故等）无法正常出勤，且已及时向单位说明情况，应向单位详细解释说明，并提供相应的证据材料，如医院的诊断证明、事故处理报告等，争取单位的理解和谅解。
- 协商解决方案：若员工确实存在一定程度的违反规章制度行为，但并非故意或情节较轻，可以与单位协商从轻处理的方式，如给予警告处分、扣减部分绩效奖金等，而不是直接面临解除劳动合同等严重后果。
核查单位处理程序的合法性
- 规章制度制定程序：根据《劳动合同法》规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。员工可以要求单位出示相关规章制度制定的民主程序文件，如职工代表大会会议记录、协商记录等，以确认该规章制度是否合法有效。
- 规章制度公示程序：用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。员工可以询问单位是通过何种方式公示规章制度的，如是否在公司内部公告栏张贴、是否通过电子邮件发送给员工等，并要求单位提供相应的公示证据。如果单位无法证明规章制度已向员工公示，那么该规章制度对员工不具有约束力，单位不能依据该规章制度对员工进行处理。
- 处理程序合规性：单位在依据规章制度对员工进行处理时，应当遵循一定的程序。例如，在作出解除劳动合同等重大处理决定前，应当事先将理由通知工会，听取工会的意见。员工可以要求单位出示相关处理程序的文件，如通知工会的函件、工会的回复意见等，以确认单位是否按照法定程序进行处理。
准备证据应对不利处理
- 收集有利证据：员工应收集能够证明自己不存在严重违反规章制度行为或存在从轻、减轻情节的证据。除了前面提到的因不可抗力因素导致考勤异常的证据外，还可以收集与工作相关的其他证据，如工作记录、工作成果、客户评价等，以证明自己对单位做出了贡献，并非故意违反规章制度。
- 整理考勤相关证据：员工可以整理自己的考勤记录，如打卡记录、请假申请等，与单位倒查的考勤记录进行核对，查看是否存在误差或错误记录的情况。如果发现单位考勤记录有误，应及时向单位提出异议，并提供自己的考勤证据进行证明。
考虑法律救济途径
- 申请劳动仲裁：如果员工与单位无法通过沟通协商解决问题，且认为单位的处理决定侵犯了自己的合法权益，可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请仲裁时，员工需要提交仲裁申请书、相关证据材料等，仲裁委员会将根据双方提供的证据和陈述进行审理，并作出裁决。
- 提起诉讼：如果员工对劳动仲裁裁决不服，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。法院将对案件进行全面审理，并根据事实和法律规定作出判决。