当汽车在过停止线时黄灯亮起并发生事故，处理这一情况需要遵循一系列明确且有条理的步骤。以下是一个详细的处理指南：
一、现场处理与初步措施
立即停车并设置警示：
- 事故发生后，首要任务是确保安全，立即停车，并开启危险报警闪光灯。
- 在车辆后方适当距离（普通道路50-100米，高速公路150米以外）放置三角警示牌，以警示其他车辆，防止二次事故的发生。
检查人员伤亡并报警：
- 迅速检查事故现场是否有人员受伤，如有受伤人员，应立即拨打120急救电话。
- 同时，拨打122报警电话，向警方报告事故发生的时间、地点、大致经过以及人员伤亡情况。
保护事故现场：
- 在等待警方到达的过程中，尽量保持事故现场的原始状态，不要随意挪动事故车辆或物品。
- 如果需要移动车辆以避免交通堵塞，应先用手机拍照记录事故现场的全貌，以便后续处理。
二、责任认定与交警调查
配合交警调查：
- 警方到达后，应如实陈述事故发生的经过，提供相关信息和证据，如行车记录仪视频、现场照片等。
- 交警会进行现场勘查，包括测量车辆位置、痕迹检验等，以确定事故的原因和责任。
责任划分：
- 交警部门一般会在10个工作日内出具交通事故责任认定书。
- 责任认定会综合考虑各方在事故中的违法行为、过错程度等因素。如果黄灯过线一方符合交通规则且无其他违法行为，可能不承担责任；但如果存在超速、未确保安全通过等违法行为，则需承担相应责任。
申请复核：
- 如果对责任认定结果不服，可以在规定时间内向交警部门申请复核。
三、保险理赔与后续赔偿
通知保险公司：
- 事故发生后，应尽快拨打保险公司客服电话报案，提供详细的事故信息。
定损理赔：
- 保险公司会派定损人员对事故车辆损失进行评估。
- 提供必要的证明材料，如事故责任认定书、车辆行驶证、驾驶证等。
- 保险公司根据保险合同约定进行理赔，理赔金额会直接支付给受损方或维修厂。
后续赔偿处理：
- 根据责任比例确定具体的赔偿数额。
- 赔偿项目可能包括人身损害赔偿（如医疗费、误工费、护理费等）和财产损失赔偿（如车辆维修费、物品损失费等）。
- 双方可以就赔偿事宜进行协商，达成一致后签订赔偿协议。如果协商不成，受害人可以向人民法院提起民事诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、法律建议与预防措施
- 在处理过程中如有疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助，确保自身权益得到保护。
- 驾驶员应时刻遵守交通规则，不闯黄灯、红灯，确保行车安全，避免事故的发生。
综上所述，汽车在过停止线时黄灯亮起并发生事故后，应立即停车报警并通知保险公司，等待交警进行现场处理和责任认定。在损害赔偿方面，应优先通过保险公司理赔，并尝试与对方协商解决。如有需要，可寻求交警部门调解或法律途径解决争议。最重要的是，驾驶员应始终遵守交通规则，预防事故的发生。