针对您提出的问题“通过路口时，刚过停止线黄灯亮了，把车停下来，怎样处罚”，以下是我为您提供的详细解答：
一、黄灯的法律含义与规定
根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的规定，黄灯在交通信号灯中主要起到警示作用，它提醒驾驶人注意前方路口的交通状况，并准备减速或停车。当黄灯亮起时，如果车辆的前轮等部位已经越过了停止线，那么车辆有权选择继续通过路口，这并不被视为闯红灯等交通违法行为。
二、您描述的情况分析
在您描述的情况中，车辆刚过停止线黄灯就亮了，然后您选择了停车。根据上述法律规定，这种行为通常并不构成违章。因为您并没有在黄灯亮起后继续前行，而是选择了停车，这符合黄灯作为警示信号的初衷，即提醒驾驶人减速并准备停车。
三、可能面临的特殊情况
尽管一般情况下这种行为不构成违章，但您仍需注意以下几点：
停车位置：确保您的停车位置不会影响到行人正常通行或造成交通堵塞。如果停车位置不当，即使不构成闯红灯违章，也可能因妨碍交通等其他原因面临交警的现场处置。
地区差异：由于具体的交通规则可能因地区而异，不同地方对于黄灯亮时车辆的处理方式可能有所不同。因此，如果您对当地的交通法规有疑问，建议咨询当地交通管理部门以获取最准确的信息。
四、建议与注意事项
谨慎驾驶：在遇到黄灯时，驾驶人应保持警惕，减速慢行，并根据实际情况判断是否能够安全通过路口。避免在黄灯亮起后才匆忙刹车或加速通过路口，这样的行为不仅危险，还可能违反其他交通法规。
遵守交通法规：无论黄灯是否处罚，驾驶员都应严格遵守交通信号灯的指示，确保行车安全。这是每位驾驶人的基本责任和义务。
了解地区差异：由于不同地区对闯黄灯的执法尺度存在差异，驾驶员在行驶过程中应了解并遵守当地的交通法规。这样可以帮助您更好地适应不同的交通环境，避免不必要的法律风险。
综上所述，您描述的情况在一般情况下并不构成违章。但为了确保行车安全和遵守交通法规，建议您在遇到黄灯时保持警惕，减速慢行，并根据实际情况做出明智的驾驶决策。如果遇到具体问题或疑问，建议咨询当地交通管理部门以获取准确的指导和帮助。