结论：在借款人是公司大股东且借款合同上有公司公章的情况下，法院能否执行公司财产，取决于多个因素，包括借款的实际用途、公司是否为共同借款人或担保人、以及是否存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务的情形等。以下是对这些因素的详细分析：

1. 借款实际用途：

   • 如果借款实际用于公司经营或公司明确表示愿意承担该债务，那么公司作为债务人，法院当然可以执行其财产。
   • 如果借款被大股东个人使用，且公司未从中受益，那么公司原则上不应承担该债务，法院不应直接执行公司财产。但需注意，若存在大股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的情形，根据《公司法》的相关规定，法院可能会“刺破公司面纱”，直接执行公司财产以保护债权人的利益。

2. 公司是否为共同借款人或担保人：

   • 如果公司在借款合同上作为共同借款人或担保人盖章，那么公司明确承担了还款责任或担保责任，法院可以直接执行公司财产。
   • 如果公司仅作为见证人或无关方盖章，且合同中未明确公司承担任何责任，那么公司不应承担该债务，法院不应直接执行公司财产。

3. 滥用公司法人独立地位和股东有限责任的情形：

   • 根据《公司法》第二十条第三款：“公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。”这意味着，如果大股东通过不正当手段将个人债务转嫁给公司，或者利用公司作为逃避债务的工具，严重损害了债权人的利益，那么法院可以“刺破公司面纱”，直接执行公司财产。

法律建议：

• 对于债权人而言，在签订借款合同时，应明确借款用途、借款人身份以及公司是否承担还款责任或担保责任等关键条款，以避免后续纠纷。
• 对于公司而言，应加强对公章的管理，防止未经授权的使用。同时，在涉及公司作为借款人或担保人的合同中，应谨慎评估风险，确保公司利益不受损害。
• 如果发生纠纷，建议及时咨询专业律师，通过法律途径维护自身权益。

可能法律后果：

• 如果法院认定公司应承担还款责任或担保责任，那么公司财产可能被执行以偿还债务。
• 如果法院认定大股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务，那么大股东可能对公司债务承担连带责任，公司财产也可能因此被执行。