针对您提出的“公司有股份撤股怎么处理”的问题，这是一个涉及公司法、股权转让及公司运营等多个方面的复杂问题。下面，我将结合有限责任公司和股份有限公司的不同规定，为您详细解答。

一、有限责任公司撤股处理

1. 股权转让：

   • 对内转让：股东之间可以自由转让股权，只需双方签订股权转让协议，并修改公司章程中的相关股东信息，随后到工商部门办理变更登记。
   • 对外转让：若股东希望向公司外部的人转让股权，则需书面通知其他股东，并获得过半数股东的同意。在同等条件下，其他股东享有优先购买权。转让成功后，同样需要修改公司章程并办理工商变更登记。

2. 公司减资：

   • 若通过减少公司注册资本的方式实现股东撤股，公司需召开股东会，并经代表三分之二以上表决权的股东通过减资决议。
   • 随后，公司需编制资产负债表及财产清单，通知债权人并在报纸上公告。
   • 债权人有权要求公司清偿债务或提供相应担保。完成这些程序后，再到工商部门办理减资登记。

3. 公司回购：

   • 在特定情形下，如公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利等，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权。
   • 若双方协商不成，股东可在规定期限内向人民法院提起诉讼。

二、股份有限公司撤股处理

1. 股份转让：

   • 股份有限公司的股份转让相对自由，但需遵守公司章程及法律法规。
   • 记名股票由股东以背书方式或法律、行政法规规定的其他方式转让，并办理过户登记。
   • 无记名股票的转让，则由股东将该股票交付给受让人后即发生转让的效力。

2. 公司减资：

   • 若通过减资方式实现撤股，流程与有限责任公司类似，需经股东大会决议、通知公告债权人等。

三、撤股过程中的注意事项

1. 合法合规：撤股过程必须严格遵守法律法规和公司章程的规定，否则可能引发纠纷，给股东带来巨大损失。

2. 及时沟通：在撤股过程中，股东应与公司及其他股东保持及时沟通，协商解决可能出现的问题。

3. 资产清算：若撤股涉及公司资产清算，应成立清算组，接管公司财产，分别编制资产负债表和财产清单，全面清查公司资产，并核实公司负债。

4. 债务清偿：在资产清算过程中，应按顺序清偿债务，包括清算费用、职工工资、社会保险费用和法定补偿金、所欠税款以及公司债务。

5. 剩余财产分配：在清偿完所有债务后，若还有剩余财产，应按照股东的出资比例或公司章程的规定进行分配。

综上所述，公司撤股份的处理方式因公司类型（有限责任公司或股份有限公司）及撤股方式（股权转让、公司减资、公司回购）的不同而有所差异。在处理过程中，务必确保合法合规，妥善处理好与公司及其他股东的关系，以保障各方的合法权益。