核心结论：公司破产且工资流水丢失的情况下，您仍可通过多种途径证明劳动关系及工资标准，进而主张工资、经济补偿等合法权益。以下分情况说明具体操作方式：

1. 证明劳动关系：替代性证据的收集

工资流水是证明劳动关系的重要证据，但并非唯一证据。根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），您可通过以下证据替代工资流水：

• 劳动合同：直接证明劳动关系及工资标准（如合同中约定了工资数额）。
• 工作证、工牌、考勤记录：证明您在公司实际工作的事实。
• 社保缴纳记录：公司为您缴纳社保的记录可间接证明劳动关系。
• 同事证言：同事的书面证言或出庭作证，证明您在公司的工作情况。
• 工作邮件、微信聊天记录：与公司沟通工作的记录，尤其是涉及工资、工作安排的对话。
• 公司文件或公告：如公司内部通知、任命文件等，证明您的工作身份。

建议：优先收集劳动合同、社保记录等直接证据；若无，可结合多项间接证据形成证据链。

2. 证明工资标准：多途径推定工资数额

若工资流水丢失，可通过以下方式确定工资标准：

• 银行转账记录（非工资流水）：若公司通过其他账户或第三方支付工资，可尝试调取相关记录。
• 公司财务凭证：如公司破产管理人接管后，可申请查阅公司财务账簿中的工资发放记录。
• 行业平均工资标准：若无法证明具体工资数额，可参考同行业、同岗位的平均工资水平（需结合工作年限、技能等因素调整）。
• 口头约定证据：如与公司负责人或HR的录音、聊天记录中提及工资数额，可作为辅助证据。

法律依据：根据《工资支付暂行规定》第六条，用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间等，并保存两年以上备查。公司破产时，管理人有义务整理并公开相关财务资料。

3. 公司破产程序中的权利主张

公司破产时，您的工资债权属于优先清偿范围（根据《企业破产法》第一百一十三条），但需按以下步骤操作：

• 申报债权：向破产管理人提交债权申报材料，包括劳动关系证明、工资标准证据等。
• 参与债权人会议：了解破产进展，监督破产财产分配。
• 异议权：若对管理人认定的工资数额有异议，可向法院提起诉讼或申请仲裁。

注意：破产程序中，工资债权的清偿顺序优先于普通债权，但劣后于破产费用和共益债务。

4. 特殊情况处理

• 公司未破产但拒不支付工资：可直接向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，无需依赖工资流水。
• 工资流水丢失但公司承认欠薪：可要求公司出具书面欠薪证明，或通过调解、仲裁确认债权。
• 公司已注销：若公司未依法清算即注销，股东或实际控制人可能需承担赔偿责任（根据《公司法司法解释二》第二十条）。

总结：工资流水丢失不影响您主张权利，关键是通过其他证据证明劳动关系及工资标准。建议尽快收集替代证据，并向破产管理人申报债权。如有疑问，可直接向我咨询具体操作细节。