可以限制控股股东，但需通过合法、合规的途径进行。以下从不同角度为您详细分析：

一、公司章程的约定

1. 公司章程的自治性：公司章程是公司的“宪法”，具有高度的自治性。在制定或修改公司章程时，股东可以就控股股东的权利和义务进行特别约定，以限制其滥用控股地位。
2. 具体限制措施：例如，可以约定控股股东在行使表决权时，需遵循一定的程序或条件；或者约定控股股东在特定事项上（如重大投资、资产处置等）需经其他股东同意方可实施。这些约定需符合法律法规的规定，且不得损害公司、其他股东或债权人的利益。

二、股东协议的约定

1. 股东协议的效力：股东之间可以签订股东协议，就股东之间的权利义务关系进行约定。这种约定对协议各方具有约束力，但不得违反法律法规的强制性规定。
2. 限制控股股东的条款：在股东协议中，可以约定控股股东在行使某些权利时需受到限制，如限制其转让股权、限制其参与公司管理决策等。这些条款需明确、具体，且符合法律法规的规定。

三、法律法规的约束

1. 信息披露义务：根据《公司法》等相关法律法规，控股股东需履行信息披露义务，确保公司及其他股东能够及时了解其持股情况、交易情况等。这有助于防止控股股东利用信息优势进行不正当交易或损害公司利益。
2. 禁止滥用权利：法律法规明确禁止控股股东滥用其权利损害公司、其他股东或债权人的利益。如控股股东存在滥用权利的行为，其他股东或公司可以依法提起诉讼，要求其承担相应的法律责任。
3. 股东代表诉讼：在控股股东损害公司利益的情况下，其他股东可以依法提起股东代表诉讼，代表公司追究控股股东的法律责任。这有助于维护公司和其他股东的合法权益。

四、实际操作中的建议

1. 完善公司治理结构：通过设立独立董事、监事会等机构，加强对控股股东的监督和制衡，防止其滥用权利。
2. 加强信息披露和透明度：确保公司及时、准确地披露控股股东的持股情况、交易情况等，提高公司的透明度，减少信息不对称带来的风险。
3. 依法维权：如发现控股股东存在滥用权利或损害公司利益的行为，其他股东或公司应依法及时采取措施进行维权，包括提起诉讼、要求赔偿等。

风险提示：在限制控股股东的过程中，需确保所采取的措施合法、合规，不得违反法律法规的强制性规定。否则，可能面临法律风险和责任。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。