若物业公司以不合理理由限制业主仅录入三个人脸信息，业主可通过以下途径维权：

1. 核查物业服务合同与小区管理规约
   首先需审查业主与物业公司签订的《物业服务合同》或小区《管理规约》中是否对人脸识别系统使用规则、录入人数限制等条款作出明确约定。若合同中未约定限制人数，或约定内容违反《民法典》第944条关于“物业服务人不得以停止物业服务等方式催交物业费”的强制性规定（延伸至不得以技术限制胁迫业主服从管理），则物业公司的行为构成违约，业主有权要求其解除限制。

2. 主张个人信息保护权益
   根据《个人信息保护法》第13条，物业公司收集人脸信息需满足“为履行合同所必需”或“取得个人单独同意”等条件。若业主家庭实际居住人数超过三人，物业公司仅允许录入三人信息可能涉嫌过度收集个人信息（超出必要范围）。业主可依据《个人信息保护法》第47条要求物业公司删除超出部分人员信息或扩大录入权限，同时可向网信部门投诉（第66条）。

3. 通过业主委员会介入协调
   若小区已成立业主委员会，业主可联合其他受影响业主，通过业主委员会向物业公司发出书面函件，要求其提供限制录入人数的合法依据（如设备容量限制、安全管理需要等）。若物业公司无法提供合理说明，业主委员会可依据《物业管理条例》第15条召开业主大会，表决是否更换物业公司或调整管理规约。

4. 行政投诉与司法救济

   • 行政投诉：向当地房管部门或物业主管部门投诉物业公司滥用管理权限（依据《物业管理条例》第48条），要求行政机关责令整改。
     
   • 民事诉讼：若物业公司拒不改正，业主可向法院提起民事诉讼，主张物业公司侵犯业主共有权（人脸识别系统属小区共有设施）或人格权（隐私权、个人信息权益），要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。

操作建议：

• 优先通过书面形式（如律师函、业主联名信）向物业公司提出异议，保留送达证据；
  
• 收集家庭实际居住人数证明（如户口本、居住证）、物业公司限制录入的通知等证据；
  
• 若涉及群体性纠纷，可推选代表与物业公司谈判，降低维权成本。
  

如需进一步分析具体证据或起草法律文书，可直接向我提供案件细节。