不动产证权籍调查没让邻居签字，这一行为是否合法，需分情况讨论：
若权籍调查不涉及邻居权益：
- 在这种情况下，不动产证权籍调查主要关注的是房屋本身的权属、面积、结构等信息，并不直接涉及邻居的土地或房屋权益。因此，即使邻居没有签字，这一调查行为仍然是合法的。因为签字确认通常是对涉及自身权益事项的认可，若不涉及邻居权益，则无需邻居签字。
若权籍调查涉及邻居权益（如边界争议）：
- 当不动产证权籍调查涉及与邻居的边界争议、共有部分使用等权益时，邻居的签字就显得尤为重要。因为邻居作为相关权益方，其签字可以视为对调查结果的认可或至少是对调查过程的知情。若在此情况下未让邻居签字，可能会引发后续的纠纷或争议。
- 具体处理建议：
- 主动沟通：首先，应尝试与邻居进行沟通，解释权籍调查的目的和意义，以及签字确认的重要性。了解邻居拒绝签字的原因，并尝试消除其疑虑。
- 协商解决方案：针对邻居提出的问题和异议，积极寻求解决方案。例如，可以邀请专业的测绘机构进行现场测量，明确边界位置，以消除争议。
- 寻求第三方协助：若双方无法自行协商解决，可以向当地的村民委员会、居民委员会或乡镇政府求助，请求他们协助调解。这些机构作为基层群众自治组织或政府部门，有责任和义务协助解决村民或居民之间的纠纷。
- 依法处理：若经过多次沟通和协商仍无法解决争议，且认为自己的合法权益受到侵害，可以向上级土地管理部门申请行政复议或直接向人民法院提起诉讼。在复议或诉讼过程中，需要提供充分的证据来证明自己的主张。
法律背景与依据：
- 根据相关法律法规，不动产证权籍调查是办理不动产登记的重要环节，其目的是确认不动产的权属、面积、结构等信息。在调查过程中，应尽可能确保相关权益方的知情权和参与权。
- 若调查涉及相邻关系等权益争议，应遵循《民法典》中关于相邻关系的规定，如《民法典》第二百八十八条：“不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。”以及第二百八十九条：“法律、法规对处理相邻关系有规定的，依照其规定；法律、法规没有规定的，可以按照当地习惯。”
可能法律后果：
- 若未让涉及权益的邻居签字，且后续引发纠纷或争议，可能会面临行政复议、诉讼等法律程序，增加解决纠纷的成本和时间。
- 在极端情况下，若因未签字导致调查结果被质疑或推翻，可能会影响不动产登记的办理和房屋的权属确认。
总结与建议：
- 在进行不动产证权籍调查时，应尽可能确保相关权益方的知情权和参与权。若调查涉及邻居权益，应主动与邻居沟通并争取其签字确认。
- 若遇到邻居拒绝签字的情况，应积极寻求解决方案，包括沟通协商、寻求第三方协助和依法处理等。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。