代法人代表签协议是否合法，需根据具体情况判断，以下从不同角度为您详细分析：
有合法授权的代签有效
- 法律解释：法人可以通过书面形式（如授权委托书）明确委托他人代签协议。授权委托书中应详细载明代理人的姓名或名称、代理事项、权限和期限，并由法人盖章或法定代表人签字。在此情况下，代理人在授权范围内代签的协议，对法人具有法律约束力。
- 举例说明：例如，甲公司委托员工李某与乙公司签订买卖合同，并出具了明确的授权委托书，那么李某代签的合同对甲公司有效。
构成表见代理的代签有效
- 法律解释：如果行为人没有代理权、超越代理权或代理权终止后，仍以法人名义代签协议，但相对人有理由相信行为人有代理权，则代理行为有效，协议对法人具有约束力。“有理由相信”通常基于多方面因素判断，如行为人持有法人的空白合同书、介绍信，或长期代表法人与相对人进行业务往来等。
- 举例说明：张某原是A公司业务员，经常代表A公司与B公司签订合同。离职后未通知B公司，仍以A公司名义与B公司签订新合同，B公司基于以往交易习惯有理由相信张某仍有代理权，则该合同对A公司有效。
无权代理且不构成表见代理的代签效力待定
- 法律解释：若代签人没有获得法人的授权，也不构成表见代理，此时代签的协议属于效力待定的协议。协议效力取决于法人事后是否追认。如果法人追认，则协议自始有效；如果法人拒绝追认，则协议对法人不发生效力，由代签人承担相应的法律责任。
- 举例说明：王某未经C公司授权，擅自以C公司名义与D公司签订合同，C公司得知后明确表示不认可，则该合同对C公司无效，D公司因此遭受的损失可由王某承担赔偿责任。
总结与建议：
- 在代法人代表签协议时，务必确保代签人具有合法授权或事后能得到法人的追认。
- 为避免不必要的法律风险，建议在代签前仔细审查授权委托书或相关证明文件，并确认代理人的身份和权限。
- 对于长期合作的代理人或业务伙伴，也应及时了解并更新其代理权限信息，以确保协议的合法有效性。
如果您在代法人代表签协议过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解答。