关于船长被扣押后是否受到不公正待遇的问题，这并非一个可以直接给出肯定或否定答案的简单问题，而是需要依据具体情况和法律规定进行综合分析。以下是我从不同角度为你提供的详细分析：
扣押的合法性基础：
- 首先，要明确船长被扣押的合法性。扣押行为必须基于合法的法律程序和明确的法律依据，如涉嫌犯罪、违反国际法或国内法等。如果扣押行为本身缺乏合法性基础，那么船长很可能受到了不公正待遇。
扣押过程中的权利保障：
- 在扣押过程中，船长应享有一系列基本权利，如人身安全权、获得法律援助权、与外界联系权等。如果扣押方剥夺了船长的这些基本权利，或者未按照法定程序进行扣押，那么船长很可能受到了不公正待遇。
- 例如，如果扣押方未允许船长与家人或律师联系，或者未提供必要的生活条件，这些都可能构成不公正待遇。
扣押后的待遇：
- 扣押后，船长应受到人道对待，不得遭受酷刑、虐待或侮辱。如果船长在扣押期间遭受了身体或心理上的伤害，或者被剥夺了基本的生活需求，如食物、水、医疗等，那么这明显是不公正待遇。
- 此外，扣押方还应确保船长能够及时接受司法审查，以确定扣押的合法性和必要性。如果扣押方无故延长扣押期限或拒绝司法审查，这也可能构成不公正待遇。
国际法和国内法的适用：
- 在分析船长是否受到不公正待遇时，还需要考虑国际法和国内法的适用。如果扣押行为发生在国际水域或涉及跨国因素，那么国际法（如联合国海洋法公约）可能适用。同时，国内法也可能对扣押行为有具体规定。
- 需要仔细审查相关法律规定，以确定扣押行为是否符合法律要求，以及船长是否受到了法律保护。
实际案例与司法实践：
- 在实际案例中，船长被扣押后是否受到不公正待遇往往取决于具体案情和司法实践。有些案例中，船长可能因涉嫌犯罪而被合法扣押，并受到了公正对待；而在其他案例中，船长可能因政治、经济或其他非法律因素而遭受不公正待遇。
- 因此，在分析具体问题时，需要参考类似案例的司法判决和法律解释，以形成更全面的认识。
建议：
- 如果你或你认识的人遭遇了类似情况，建议立即寻求法律援助，与专业的律师联系以了解具体权利和应对策略。
- 同时，可以收集相关证据（如扣押通知、通信记录、医疗记录等），以支持后续的法律行动。
- 如果认为扣押行为违法或不公正，可以向相关国际组织或国内司法机关提出申诉或投诉。
最后，需要强调的是，每个案件都有其独特性和复杂性。因此，在分析船长是否受到不公正待遇时，必须依据具体情况和法律规定进行综合判断。如果你有任何具体疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。