在处理宅基地的土地使用权权属纠纷案件时，我们主要依据的是《中华人民共和国土地管理法》以及相关的土地确权登记规定，但这两者的侧重点和应用场景有所不同，下面我将为您详细解析：
一、核心法律依据
《中华人民共和国土地管理法》：
- 该法第六十二条明确规定了宅基地的分配原则，强调“一户一宅”及面积限制，这是处理宅基地使用权权属纠纷的基础法律原则。
- 在纠纷处理中，我们会首先依据该法来审查宅基地的分配是否合法，是否符合“一户一宅”的规定，以及面积是否超标等。
土地确权登记规定：
- 土地确权登记是宅基地使用权权属确认的重要手段。已登记的宅基地使用权证书是确权的主要依据，它证明了宅基地使用权的归属和范围。
- 在纠纷处理中，如果双方对宅基地使用权有争议，我们会首先查看是否有有效的土地使用权证书，以及证书上的内容是否清晰、准确。
二、权属确认规则
以登记为准：
- 在大多数情况下，已登记的宅基地使用权证书是确权的主要依据。如果证书上的内容清晰、准确，且没有争议，那么我们可以直接依据证书来确认宅基地使用权的归属。
历史遗留问题：
- 对于未登记但长期实际使用的宅基地，我们需要结合历史审批文件、村规民约等综合判断。这可能需要我们查阅相关的历史档案，了解宅基地的分配和使用情况，以及村里的相关规定和习惯。
三、处理程序与注意事项
协商调解优先：
- 在处理宅基地使用权权属纠纷时，我们首先建议双方通过协商或调解来解决争议。这可以通过村委会或乡镇司法所等组织进行，达成书面协议后可申请司法确认，以增强协议的法律效力。
行政救济途径：
- 如果协商或调解无果，双方可以向县级自然资源部门申请权属调查。对确权决定不服的，可以提起行政复议或诉讼，通过行政途径来维护自己的权益。
司法诉讼流程：
- 作为最后的解决手段，双方可以准备证据材料（如土地使用证、建房审批表、证人证言等），向宅基地所在地法院起诉。法院将依据相关法律法规和证据材料来作出判决。
四、关键证据与风险防范
关键证据：
- 在处理宅基地使用权权属纠纷时，关键证据包括土地权属证明、规划许可证、缴费凭证、分家析产协议、村集体会议记录等。这些证据将有助于我们更准确地了解宅基地的分配和使用情况，以及双方的权利和义务。
风险防范：
- 为了避免宅基地使用权权属纠纷的发生，我们建议村民及时办理宅基地使用权及房屋所有权登记，留存审批文件原件。同时，规范交易行为，转让须符合“同村、自愿、合法”条件，并签订书面合同并公证。此外，定期维护权益，每5年核查一次宅基地现状，发现侵占及时主张权利。
综上所述，处理宅基地的土地使用权权属纠纷案件时，我们既要依据《中华人民共和国土地管理法》来审查宅基地的分配是否合法，又要结合土地确权登记规定来确认宅基地使用权的归属和范围。在处理过程中，我们应优先选择协商或调解来解决争议，并注重证据的收集和保存。必要时，我们可以通过行政或司法途径来维护自己的权益。