您好，关于您提到的“女儿和妈妈断亲在法院怎么办”的问题，这其实涉及到一个法律上的核心概念，即亲子关系的法律效力。

首先，需要明确的是，在我国法律框架下，亲生父母子女关系是基于子女出生的法律事实而自然发生的，这种关系在通常情况下是不允许通过协议或其他方式解除的。也就是说，无论女儿和妈妈之间发生了什么矛盾或冲突，她们之间的亲子关系在法律上都是无法被单方面“断绝”的。

接下来，我们进一步探讨这个问题的法律后果。即使女儿和妈妈之间签订了所谓的“断绝亲子关系”的协议，这种协议在法律上也是没有任何效力的。因为亲子关系不是一种可以随意设立或解除的民事法律关系，它受到法律的严格保护。因此，无论双方是否达成这样的协议，女儿对妈妈仍然负有赡养、扶助和保护的义务，这是法律规定的强制性义务，不能通过协议来免除。

那么，如果女儿和妈妈之间确实存在无法调和的矛盾或冲突，应该怎么办呢？在这种情况下，我建议双方可以尝试通过沟通、协商或调解等方式来解决问题。如果沟通无果，也可以寻求专业的心理咨询或家庭治疗师的帮助，以改善双方的关系。如果矛盾已经激化到无法通过协商或调解解决的地步，那么可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益，但这并不意味着可以“断绝”亲子关系，而是可能涉及到赡养费、财产分割等其他法律问题。

最后，我想强调的是，家庭是社会的基本细胞，家庭和谐稳定对于社会文明安定至关重要。因此，在处理家庭矛盾或冲突时，我们应该尽量保持冷静和理性，通过合法、合理、合情的方式来解决问，以维护家庭的和谐与稳定。希望这些解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。